PAPIA システム 更新情報

2002年 2月 18日（月） 最終更新

お知らせ

2002年2月20日 10:00 〜 18:00
メンテナンスのためPAPIAシステムを停止いたします。
御迷惑をおかけしますが、御了承下さい。

2001年 8月 16日

• PDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2001_08_10 )

2001年 7月 10日

• タンパク質構造検索, タンパク質配列相同性検索, タンパク質配列マルチプルアライメントにおけるPDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2001_05_16 )

2001年 7月 3日

• PDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2001_05_16 )

2001年 3月 29日

• タンパク質構造検索, タンパク質配列相同性検索, タンパク質配列マルチプルアライメントにおけるPDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2001_01_07 )

2001年 3月 13日

• PDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2001_01_07 )

2000年 10月 25日

• PDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2000_09_24 )

2000年 9月 26日

• PDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2000_08_06 )

2000年 6月 29日

• PDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#2000_06_11 )

2000年 3月27日

• タンパク質構造検索 の結果で、記述部分の引用元をPDBファイル中の " HEADER の classification " から " COMPND の specification list "に変更しました。

2000年 1月

• タンパク質構造検索 の結果画面から、RasMolをLaunch できるようになりました。

1999年 9月 20日

• タンパク質構造検索の構造比較用ビューワに以下の表示機能が追加されました。
  1. Residue Labels
  2. Residue Numbering
  3. Ball and Stick Mappings
  4. Color Mappings
  5. Font Control
  6. C&N Terminals

1999年 9月 16日

• タンパク質配列相同性検索で、メソッドを３種類( local local, global local, global global)から選択可能になりました。

• タンパク質構造検索にアミノ酸配列の相同性による構造検索が加わりました。

1999年 9月 16日

• PDB-REPRDB のデータが更新されました。 ( based on PDB Rel.#89 )

1999年 6月 18日

• タンパク質構造検索 − 三次元座標入力 の結果で、検索された構造の配列を表示できるようになりました。

1999年 3月 30日

• PDB-REPRDB Dynamic 1.0 ( based on PDB Rel.#86 ) を公開しました。

1999年 2月 5日

• タンパク質配列マルチプルアライメント で探索方法として A* アルゴリズムが利用可能になりました。

1999年 1月 8日

• PDB-REPRDB Version 8.0 ( based on PDB Rel.#85 ) を公開しました。

1998年 12月 25日

• タンパク質二次構造予測 が FASTA 形式のデータを使用出来るようになりました。

1998年 11月 18日

• タンパク質配列相同性検索 および タンパク質配列マルチプルアライメント で利用可能な類似度評価行列が５種類に増えました。

1998年 11月 7〜13日

• 米国フロリダで開催された、 SC98 : HIGH PERFORMANCE NETWORKING AND COMPUTING CONFERENCE に PAPIAシステムを出展、デモを行ないました。 ( Booth R230 )
  Brochure [MS Word]

1998年 10月 8日

• タンパク質構造検索 - 三次元座標入力 が PDBファイルの ATOM 行を直接利用できるようになりました。

1998年 8月 21日

• PDB-REPRDB Version 7.0 ( based on PDB Rel.#84 ) を公開しました。

1998年 7月 14日

• タンパク質配列相同性検索 が FASTA 形式のデータを使用出来るようになりました。

1998年 7月 8日

• タンパク質配列相同性検索 の結果がペアワイズアライメントの表示になりました。
• タンパク質配列相同性検索 の結果を直接タンパク質配列マルチプルアライメントに渡すことができるようになりました。

1998年 6月 26日

• タンパク質構造検索 - PDB-REPRDB のタンパク質断片を指定 の結果で、問い合わせ断片の構造も見つかった構造と合わせて構造ビューアで見られるようになりました。
• タンパク質配列相同性検索で以下の２点を変更しました。
  1. 閾値は上限と下限を指定できるようになりました。
  2. 'BLOSUM80' と 'PAM250' の２つの評価マトリクスから選択できるようになりました。

1998年 6月 25日

• タンパク質構造検索 および タンパク質配列相同性検索に使用される PDB-REPRDB を、より大きなデータセット( ID = 95%, MAXD = 10A ) に変更しました。

1998年 6月 1日

• PDB-REPRDB の日本語版ができました。

1998年 5月 25日

• 記者発表を行ない、PAPIAシステムを正式公開しました。

1998年 5月 22日

• PAPIAシステム日本語版ページができました。

1998年 5月 7日

• PDB-REPRDB Version 6.0 ( based on PDB Rel.#83 ) を公開しました。

1998年 4月 20日

• PAPIAシステムのWWW上でのサービスを試験的に開始しました。
• タンパク質配列相同性検索 でデータベースとして 'SWISS-PROT' を選択できるようになりました。
• タンパク質配列相同性検索 の結果に '記述' 項目を追加しました。

1998年 4月 17日

• タンパク質二次構造予測 がメニューに加わりました。

1998年 3月 27日

• PDB-REPRDB Version 5.0 ( based on PDB Rel.#82 ) を公開しました。

1998年 3月 13日

• タンパク質構造検索 - PDB-REPRDB のタンパク質断片を指定 がメニューに加わりました。

1998年 3月

'サービス稼働状況'のページが出来ました。

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1998年 2月

• タンパク質構造検索 - アミノ酸配列の完全一致 がメニューに加わりました。

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1998年 1月

• Java で書かれていた結果ページを HTML に置き換えました。

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1997年 11月 15〜21日

• SC'97 : High Performance Networkingand Computing (US San Jose)において、RWC PC ClusterII 上に実装した PAPIAシステムのデモンストレーションを行ないました。

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