ゲノム情報研究センター[CBRC]

2013年2月8日掲載

　最近のコンピュータサイエンスの技術などを用い、健康科学分野への挑戦的な研究を発表する国際学会GLOBAL HEALTH 2012 が2012年10月21日〜26日までイタリアのベネチアで開催されました。
この学会では、28%〜42%の論文が口頭発表として採択され、口頭発表に選択された論文の中からベストペーパー賞を授与しています。
今回、本研究センター細胞システム解析チームの油谷幸代研究員が著者である以下の論文がベストペーパーとして選ばれました。

Web Page：　http://www.iaria.org/conferences2012/AwardsGLOBALHEALTH12.html

論文概要

• タイトル:Application of Structural Equation Modeling for Inferring Toxicity-Dependent Regulation in Human Embryonic Stem Cells
• 著者:Sachiyo Aburatani, Wataru Fujibuchi

　Abstract─ Chemical toxicity threat our daily health, especially for embryos. Reveling toxicity-dependant regulation in human embryo is one of the effective approaches to prevent some chemical effects. In previous study, we developed a network inference approach, based on Structural Equation Modeling (SEM). In this study, we improved the SEM approach and applied this enhanced approach to expression profiles in human embryonic stem cells exposed to various chemicals. The inferred gene regulatory models among neurodevelopment related genes clarify the differences between chemicals, and the network shapes reflected the features of chemical toxicities. The effects of Acrylamide toxicity finally aggregated to a neuronal cell-related gene, even though Diethylnitrosamine disturbed normal cell differentiation-related genes. Furthermore, gene regulatory network with Thalidomide was complicated, but embryonic development-related genes were estimated as the finally effected genes by Thalidomide toxicity.