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- ■情報基盤統合
- ■ゲノム配列解析
- ■細胞システムの解析
- ■タンパク質の構造・機能予測
Workflow |
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| 統合DB情報基盤サイト | |
| http://togo.cbrc.jp/ |
ALN |
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| ２つの配列または配列グループ間を アラインメントするプログラム |
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| http://www.cbrc.jp/ALN/ |
CentroidFold |
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| RNA二次構造予測ソフトウェア | |
| http://www.ncrna.org/centroidfold/ |
GUPPY |
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| 遺伝子配列におけるデータの意味を註釈した 情報を表示できるプログラム |
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| http://www.cbrc.jp/GUPPY/ |
LAST |
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| 大規模ゲノム配列比較ソフトウェア | |
| http://last.cbrc.jp/ |
MAFFT |
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| 多重配列アラインメントプログラム | |
| http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/ |
Murlet |
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| 構造RNAのマルチプルアライメント プログラム |
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| http://murlet.ncrna.org/ |
paraclu |
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| 配列に付属するデータの中からクラスターを 発見するプログラム |
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| http://www.cbrc.jp/paraclu/ |
Rfold |
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| 長いDNA配列の局所的な塩基対確率を 計算するソフトウェア |
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| http://www.ncrna.org/software/rfold/ |
seg-suite |
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| 配列セグメントとアラインメントを 操作するツール |
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| http://www.cbrc.jp/seg-suite/ |
Spaln |
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| 転写産物（EST, cDNA, アミノ酸）のゲノムへのマッピングとスプライシングを考慮したアラインメント | |
| http://www.genome.ist.i.kyoto-u.ac.jp /~aln_user/spaln/ |
tantan |
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| 核酸及びアミノ酸配列から、機能が未知の リピート配列を検出する。 |
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| http://www.cbrc.jp/tantan/ |
CellMontage |
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| マイクロアレイデータ検索・解析システム | |
| http://cellmontage.cbrc.jp/ |
SAMURAI |
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| 遺伝子モジュールを高速かつ網羅的に 列挙するプログラム |
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| http://samurai.cbrc.jp/ |
FORTE |
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| プロファイル比較による タンパク質立体構造認識法 |
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| http://www.cbrc.jp/forte/ |
GRIFFIN |
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| GPCRーGタンパク質結合選択性 予測システム |
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| http://griffin.cbrc.jp/ |
GRIP |
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| GPCR多量体化インターフェイス予測ツール | |
| http://grip.cbrc.jp/GRIP/ |
POODLE |
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| タンパク質ディスオーダー予測 | |
| http://mbs.cbrc.jp/poodle/ |
TMBETA-NET |
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| 膜貫通タンパクのベータストランド予測 をするプログラム |
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| http://psfs.cbrc.jp/tmbeta-net/ |
WoLF PSORT |
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| タンパク質細胞内局在化予測ソフト | |
| http://wolfpsort.org |
ScreenCap3 |
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| Caspase-3の基質とcleavage siteの予測 | |
| http://scap.cbrc.jp/ScreenCap3/ |
MitoFates |
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| ミトコンドリアタンパク質のプレ配列と cleavage site の予測 | |
| http://mitf.cbrc.jp/MitoFates/ |
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