September 11(Wed) - 13(Fri), 2013
The Annual Workshop of Computational Biology Research Center, AIST
【Language】:English
10:00~10:10 | [Talk / HPCI Workshop2013] Greetings |
10:10~10:45 | [Talk / HPCI Workshop2013] 玉田 嘉紀(東京大学大学院 情報理工学系研究科) "京を用いた超並列アルゴリズムによる大規模遺伝子ネットワーク推定手法の研究開発とその応用" |
10:45~11:20 | [Talk / HPCI Workshop2013] 池口 満徳(横浜市立大学大学院 生命医科学研究科) "生体超分子の分子シミュレーション" |
11:20~11:55 | [Talk / HPCI Workshop2013] 田中 成典(神戸大学大学院 システム情報学研究科) "第一原理シミュレーションと創薬" |
12:15~12:45 | ランチョンセミナー 菱化システム |
13:30~13:40 | [Talk / JSBi 第17回創薬インフォマティクス研究会] 本間 光貴(理化学研究所 CLST) "イントロダクション" |
13:40~14:15 | [Talk / JSBi 第17回創薬インフォマティクス研究会] 佐藤 朋広(理化学研究所 CLST) "インシリコによるポリファーマコロジー予測技術の変遷" |
14:15~14:50 | [Talk / JSBi 第17回創薬インフォマティクス研究会] 馬見塚 拓(京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター) "Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network" |
14:50~15:00 | 休憩 |
15:00~15:35 | [Talk / JSBi 第17回創薬インフォマティクス研究会] 西脇 栄治(カルナバイオサイエンス) "細胞内シグナル伝達解析手法としての逆相蛋白アレイ(RPPA)" |
15:35~16:10 | [Talk / JSBi 第17回創薬インフォマティクス研究会] 鹿島 久嗣(東京大学大学院 情報理工学研究科) "ネットワーク構造予測のための機械学習" |
16:10~16:40 | [Talk / JSBi 第17回創薬インフォマティクス研究会] パネルディスカッション |
17:00~18:00 | [Poster / CBRC2013] ポスターセッション |
10:00~10:20 | [Talk / CBRC2013] Paul Horton(Principal Research Manager, CBRC, AIST) "Advances in Predicting Protein Sub-cellular Localization Signals" |
10:20~10:40 | [Talk / CBRC2013] Yutaka Saito(RNA Informatics Team, CBRC, AIST) "Bisulfighter: accurate detection of methylated cytosines and differentially methylated regions" |
10:40~11:00 | [Talk / CBRC2013] Kazutaka Katoh(IFReC, Osaka University) "Multiple sequence alignment of a large number of sequences" |
11:00~11:30 | [Talk / CBRC2013] Anish MS Shrestha(Department of Computational Biology, University of Tokyo) "Mapping paired-end reads to a reference genome" |
11:30~12:00 | [Talk / CBRC2013] Martin Frith(Sequence Analysis Team, CBRC, AIST) "Explaining the correlated properties of mammalian promoters" |
12:00~13:30 | Lunch Break |
13:30~14:30 | [Invited Speech / CBRC2013] 馬場 嘉信(名古屋大学大学院工学研究科・革新ナノバイオデバイス研究センター、産総研 健康工学研究部門) "量子・ナノバイオデバイスが拓く未来医療" |
14:30~15:30 | [Invited Speech / CBRC2013] 笹井 理生(名古屋大学 大学院工学研究科) "真核生物の遺伝子スイッチの時空間ダイナミクスの理解に向けて" |
15:30~15:40 | Coffee Break |
15:40~16:30 | [Talk / CBRC2013] Koji Tsuda(Leader, Machine Learning Research Group, CBRC, AIST) "Statistical Significance of Combinatorial Regulations" |
16:30~17:00 | [Talk / CBRC2013] Kiyoshi Asai(Director, CBRC, AIST) "CBRC 総括" |
17:00~18:00 | [Poster / CBRC2013] ポスターセッション |
18:00~ | Banquet / Poster award |
10:00~10:20 | [Talk / CBRC2013] Kana Shimizu(RNA Informatics Team, CBRC, AIST) "An efficient privacy-preserving similarity search protocol for chemical compound databases" "類似化合物のプライバシ保護検索を行うための効率的なプロトコル" |
10:20~10:40 | [Talk / CBRC2013] Chie Motono(molprof, CBRC, AIST) "SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins" |
10:40~11:30 | [Invited Speech / CBRC2013] Natsuko Ichikawa(Biological Resource Center, NITE (NBRC)) "Development of manually curated database of secondary metabolite biosynthesis gene clusters" |
11:30~12:30 | [Invited Speech / CBRC2013] Toshiaki Katayama(DBCLS, Research Organization of Information and Systems) "International collaborations for semantic data integration and interoperability" |
12:30~13:30 | luncheon seminar Life Technologies Japan co. |
13:30~14:30 | [Invited Speech / CBRC2013] Fabien Campagne(The HRH Prince Alwaleed Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud Institute for Computational Biomedicine. Department of Physiology and Biophysics, The Weill Cornell Medical College, New York, NY, USA.) "GobyWeb: simplified management and analysis of gene expression and DNA methylation sequencing data" |
14:30~14:35 | [JSBi 第2回 生命システム理論研究会] 藤渕 航(京都大学 iPS研究所・研究会主査) "開会の辞" |
14:35~15:10 | [JSBi 第2回 生命システム理論研究会] 井元 清哉(東京大学 医科学研究所) "生体内分子ネットワークが明らかにするがんの多様な薬剤応答" |
15:10~15:45 | [JSBi 第2回 生命システム理論研究会] 山西 芳裕(九州大学 生体防御医学研究所) "ケモゲノミクスや薬理ゲノミクスの手法による薬物・標的タンパク質間相互作用ネットワークの予測" |
15:45~15:55 | 休憩 |
15:55~16:30 | [JSBi 第2回 生命システム理論研究会] 木下 修一(明治大学 先端数理科学インスティテュート) "遺伝子ネットワーク上における離散ダイナミクスのアトラクター解析" |
16:30~17:00 | [JSBi 第2回 生命システム理論研究会] Natalia Polouliakh(Sony Computer Science Laboratories, Inc.) "Future of Infertility: Systems Biology approach" |
17:00~17:30 | [JSBi 第2回 生命システム理論研究会] 富永 大介(産総研 CBRC) "マウス概日周期の遺伝子制御ネットワークの動的変化の解析" |
17:30~18:00 | [Invited Speech / CBRC2013] Jennifer Russo Wortman(Microbial Informatics, Broad Institute) "Keeping up with the next generation: bioinformatics approaches and challenges" |