ゲノム情報研究センター[CBRC]
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ゲノム情報研究センターではゲノム情報を活用するバイオインフォマティクス研究開発を行なっています。
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HPCIセミナー
平成23年度HPCIセミナー
東京大学大学院 新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻
2011年度冬学期 「情報生命科学特別講義 I」
(科目番号 47200-13)
このセミナーは HPCI戦略プログラム・分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」における人材養成プログラム のサポートにより開講します。
>> HPCI戦略プログラム分野1ホームページ
どなたでも聴講することができます。(事前申込不要)
聴講方法(会場への入室等)はこちらをご覧ください。
>> 聴講方法
会場* :
CBRC 8階コラボレーションコーナー or 10階会議室
柏キャンパス 情報生命科学実験棟 2F講義室
本郷キャンパス 理学部 3号館 412講義室
時間:14:45〜16:25 *
* 柏・本郷両キャンパスにはTV会議システムを通じて講義が配信されます。
* 柏・本郷両キャンパスでの聴講は、2011年度冬学期「情報生命科学特別講義」を履修する学生のみ可能です。その他の聴講ご希望の方はCBRCにお越しくださいますようお願いいたします。
* 初回10月7日のみ、講義時間は16:00〜17:40、前半(**)の講義会場は柏キャンパスとなり、CBRCにはTV会議システムで講義が配信されます。後半はCBRCからの中継となります。ご注意ください。
*
・・・タイトルの後ろにこの印のついたセミナーは、英語による発表です。
第1回 2011年10月7日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー(**柏からの中継)
浅井 潔**(CBRC研究センター長 /
東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻 教授)
「開講に当たって」
木立 尚孝**(東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻 准教授)
「RNA 二次元構造の熱力学的エントロピーを計算するアルゴリズムについて」
[Abstract PDF]
浜田 道昭(東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻 特任准教授)
「Maximizing Expected Accuracy Estimations in Bioinformatics」
[Abstract PDF]
第2回 2011年10月14日(金) 会場:CBRC 10階 会議室
ポール・ホートン(CBRC 配列解析チーム長)
「Perlによるfastq,fasta形式データの処理」
[Abstract PDF]
諏訪 牧子(CBRC 主幹研究員)
「嗅覚システムの統合的理解にむけて」
[Abstract PDF]
第3回 2011年10月21日(金) 会場:CBRC 10階 会議室
マーティン・フリス(CBRC 配列解析チーム)
「Pair-wise Sequence Comparison: Old and New Solutions」
[Abstract PDF]
[Slide PDF]
第4回 2011年10月28日(金) 会場:CBRC 10階 会議室
清水 佳奈(CBRC RNA情報工学チーム)
「All Pairs Similarity Search in Edit Distance」
[Abstract PDF]
富井 健太郎(CBRC 配列解析チーム)
「Cross Profile Analysis and Its Applications」
[Abstract PDF]
第5回 2011年11月4日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
加藤 和貴(大阪大学 免疫学フロンティア研究センター 特任准教授)
「Multiple Sequence Alignment」
[Abstract PDF]
藤 博幸(CBRC 副研究センター長/生体分子システム研究班)
「Analysis of Protein-Protein Interaction with Multiple Amino Acid Sequence Alignment」
[Abstract PDF]
第6回 2011年11月11日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
光山 統泰(CBRC RNA情報工学チーム長)
「哺乳類ゲノムに保存されたRNA構造因子の網羅的探索」
[Abstract PDF]
野口 保(CBRC 主幹研究員)
「タンパク質発現・可溶性予測法とタンパク質ディスオーダー領域予測」
[Abstract PDF]
第7回 2011年11月18日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
長野 希美(CBRC 生体分子システム研究班)
「酵素の立体構造と触媒機能」
[Abstract PDF]
津田 宏治(CBRC 機械学習研究班長)
「高速検索技術のバイオインフォマティクスへの応用」
[Abstract PDF]
第8回 2011年11月25日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
末永 敦(CBRC 分子機能計算チーム)
「生体高分子の分子シミュレーション -計算機支援創薬にむけて-」
[Abstract PDF]
[Slide PDF]
第9回 2011年12月2日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
油谷 幸代(CBRC 細胞機能設計チーム)
「遺伝子発現データからのネットワーク推定」
[Abstract PDF]
藤渕 航(CBRC 細胞機能設計チーム長)
「幹細胞インフォマティクスと創薬」
[Abstract PDF]
第10回 2011年12月9日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
富永 大介(CBRC 細胞機能設計チーム)
「遺伝子発現の時系列解析」
[Abstract PDF]
亀田 倫史(CBRC 創薬分子設計チーム)
「創薬技術としての分子動力学法」
[Abstract PDF]
第11回 2011年12月16日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
広川 貴次(CBRC 創薬分子設計チーム長)
「創薬インフォマティクスによる医薬品探索」
[Abstract PDF]
本野 千恵(CBRC 創薬分子設計チーム)
「Development of Structure Prediction Pipeline for Eukaryotic Proteins and SAHG Database」
[Abstract PDF]
第12回 2012年1月13日(金) 会場:CBRC 8階 コラボレーションコーナー
福井 一彦(CBRC 分子機能計算チーム長)
「Development of Infrastructure Technologies for Bioinformatics Information」
[Abstract PDF]
堀本 勝久(CBRC 生体ネットワークチーム長)
「計算システム生物学的アプローチによる疾患要因遺伝子候補の絞り込み法」
[Abstract PDF]
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