研究課題

  • ゲノム情報解析

    • チーム名
      概要

      ２次構造を考慮した高速・高精度なRNA配列情報解析技術、転写制御領域を対象とした配列モチーフ探索技術、比較ゲノム技術などの配列情報解析技術などを開発するとともに、転写制御機構の解析、遺伝子多型情報の解析、新規機能性RNA発見など、ゲノム配列情報の工学的制御の観点からの解析を行う。

      主要研究項目
      • 機能性RNA情報解析
      • 転写制御の情報解析
      目標
      • 新規機能性RNAの発見と機能予測
      • 転写制御の多面的推測とメカニズム解明
      代表的要素技術
      • RNA配列の整列・検索
      • プロモータ配列解析
      • 細胞内局在予測

  • 分子情報解析

    • チーム名
      概要

      これまでに開発してきたタンパク質構造・機能予測技術、分子シミュレーション技術などに分子設計技術を融合させ、創薬標的タンパク質・変性疾患関連ペプチド・糖鎖に特化した高精度な創薬支援技術を開発する。そのため、大規模計算技術によるタンパク質同士やタンパク質と他生体分子（核酸・化合物・糖鎖など）との複合体立体構造予測法を開発する。

      主要研究項目
      • 複合体立体構造予測
      • 化合物バーチャルスクリーニング（VS）
      目標
      • 構造変化を含む複合体構造予測技術の開発
      • 化合物VSフォーカスドライブラリ構築
      代表的要素技術
      • 高精度立体構造予測
      • ドッキングシミュレーション

  • 細胞情報解析

    • チーム名
      概要

      遺伝子発現・代謝・シグナル伝達等の細胞内ネットワークを工学的な技術に基づいて解析する。網羅的なヒト細胞データベースを構築し、細胞の形態、機能、分化転換に関する情報を遺伝子発現情報と融合させた細胞情報解析環境を開発する。機能未知の生体分子を含む細胞内ネットワークを推定し、新規な創薬標的の発見、副作用予測を支援する技術を開発する。

      主要研究項目
      • 遺伝子発現情報解析
      • 生体ネットワーク情報解析
      目標
      • 細胞分化に関わる遺伝子発現モジュールとネットワークの推定
      • 疾患関連ネットワーク推定
      • 薬理副作用予測
      代表的要素技術
      • 遺伝子発現モジュール探索
      • ネットワーク構造推定
      • ネットワーク動態解析

  • 情報基盤統合

    • チーム名
      概要

      センター内外のソフトウェア／データベースを最新の情報技術を用いてシームレスに統合したバイオインフォマティクス情報基盤の構築に取り組む。
      また、最新の数理的手法と数千プロセッサ規模の大規模計算手法を駆使した生命情報解析技術を結合し、実用的なシステムを開発する。

      目標
      • バイオインフォマティクスの要素技術を結合したパイプラインを構築
      • 外部データベースを含む知的基盤を統合化して安全にシームレスに利用できる環境を実現
      • 利用者のニーズに対応した多様なサービスを単純な操作で実現
      連携
      • 産業技術総合研究所内の関連ユニット
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