セミナー実績（2008年度）

回スケジュール タイトル発表者
第62回 03/12/(木)
14:00〜		 日印国際研究交流
(1)GRID環境の構築について（福井）
(2)ROBUSTNESS OF LONG-RANGE ORDER PARAMETER IN PREDICTING FOLDING RATES OF TWO-STATE PROTEINS（Dr. Selevarj)		 福井一彦(分子機能計算チーム),Samuel Selvaraj(Department of Bioinformatics, Bharathidasan University)
第61回 03/09/(月)
14:00〜		 核酸のダイナミクスに依存したタンパク質-核酸分子認識機構 山崎 智（東京大学 Intelligent Modeling Laboratory 特任研究員）
第60回 03/05/(木)
11:00〜		 ケミカルバイオロジーPJにおけるインシリコ解析（H20年度進捗報告） 広川　貴次（創薬分子設計チーム）
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回スケジュール タイトル発表者
第59回 02/26/(木)
14:00〜		 CASP8報告（Disorder領域予測とドメイン予測） 野口　保（副研究センター長）
第58回 02/20/(金)
14:00〜		 On Gene Expression: Microarrays and Tags エドワード　ウィジャヤ (配列解析チーム)
第57回 02/19/(木)
14:00〜		 GPUを用いた配列アラインメント 山田　真介（分子機能計算チーム）
第56回 02/13/(金)
14:00〜		 How to align genome sequences Martin Frith (配列解析チーム)
第55回 02/12/(木)
14:00〜		 これまでのGPCRsオリゴマー化研究と、今後の取り組みについて 根本　航（分子機能計算チーム）
第54回 02/06/(金)
14:00〜		 TogoWS とライフサイエンスにおけるウェブサービスの統合 中尾光輝（かずさDNA研究所 研究員）
第53回 02/05/(木)
14:00〜		 Interaction between intrinsically disordered proteins frequently occurs in a human protein-protein interaction network 清水 佳奈（分子機能計算チーム）
第52回 01/28/(水)
14:00〜		 Predicting tissue-specific transcription factor binding sites with chromatin modification information Tom Whitington (IMB, University of Queensland)
第51回 01/26/(月)
11:00〜		 Visualizing Microarray Data using a Set of Minimum Spanning Trees Raymond Wan(京都大学化学研究所 バイオインフォマティクスセンター)
第50回 01/23/(金)
14:00〜		 RNA editing in plant organelles: Correlation between editing sites and protein three-dimensional structures, and prediction of the sites 由良 敬（お茶の水女子大学大学院人間文化創成科学研究科 教授）
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回スケジュール タイトル発表者
第49回 01/22/(木)
14:00〜		 Membrane protein structure and function: development of database and discrimination algorithms Michael Gromiha（分子機能計算チーム）
第48回 01/20/(金)
17:00〜		 Aspergillus secondary metabolites: evolution of biosynthetic genes, environmental competitiveness, and pathogenicity William C. Nierman（J. Craig Venter Institute　Dr.）
第47回 01/20/(火)
16:00〜		 Functional analysis of secondary metabolism in Aspergillus Geoff Turner（Department of Molecular Biology and Biotechnology,University of Sheffield , Prof.）
第46回 01/16/(金)
14:00〜		 Sequence Analysis of Nuclear Export Signal 傅 思縉 (配列解析チーム)
第45回 01/15/(木)
15:30〜		 Folding free-energy landscapes of 10-residue proteins 佐藤　大介 (株式会社ダイナコム社)
第44回 01/15/(木)
14:00〜		 ヒトゲノム構造・機能アノテーションデータベース用のタンパク質立体構造予測パイプラインの作成 本野　千恵（創薬分子設計チーム）
第43回 12/18/(木)
14:00〜		 タンパク質立体構造を用いたリガンド結合部位の予測 森田 瑞樹（東京大学　農学生命科学研究科　アグリバイオインフォマティクス人材養成ユニット）
第42回 12/12/(金)
14:00〜		 Overrepresented Motifs in Highly Conserved Non-protein-coding Regions of Vertebrate Genomes 大里　直樹 (配列解析チーム)
第41回 12/05/(金)
15:00〜		 DNA解析技術の発展と1細胞中のmRNAの計測 神原秀記 (株式会社日立製作所 中央研究所フェロー)
第40回 12/01/(月)
14:30〜		 Evolution: a Bridge from Systems Biology to Protein Annotation and Re-design Olivier Lichtarge （Baylor College of Medicine）
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回スケジュール タイトル発表者
第39回 11/28/(金)
14:00〜		 Molecular dynamic simulations of Nuclear Receptors: Pushing the boarders of MD Sofia Burendahl (Karolinska Institutet, Sweden)
第38回 11/25/(火)
14:00〜		 タンパク質の動的領域の予測とその応用 廣瀬　修一（分子機能計算チーム）
第37回 11/21/(金)
11:00〜		 Boosting biological discovery through phylogenomics Kimmen Sjolander (UC Berkeley)
第36回 11/19/(水)
14:00〜		 HMM-based algorithm(s) for pairwise alignment of low quality reads 富井　健太郎 (配列解析チーム)
第35回 11/13/(木)
14:00〜		 現象モデルを用いたタンパク質NMRスペクトルスクリーニング手法の構築 荒井　ひろみ（東京工業大学総合理工学研究科）
第34回 10/30/(木)
14:00〜		 Gaussian Chain Network modelによる立体構造予測 亀田 倫史（創薬分子設計チーム）
第33回 10/28/(火)
14:00〜		 Machine learning and dimensionality reduction for information access and computational biology Pessiot, Jean-Fran醇Mois Kenichi (LIP6 Laboratory of Computer Science, Pierre et Marie Curie University - CNRS)
第32回 10/24/(金)
17:00〜		 Finding non-protein-coding transcripts based on 5'-inversion event 寺井　悟朗 (RNA情報工学チーム)
第31回 10/23/(木)
16:00〜		 細胞老化の分子メカニズムとその生体内での役割 原　英二 (財団法人癌研究会 癌研究所)
第30回 10/23/(木)
14:00〜		 標的タンパク質構造に基づくファーマコフォアモデルの構築とVirtual screeningへの応用 平山　和徳（早稲田大学先進理工学研究科／創薬分子設計チーム）
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回スケジュール タイトル発表者
第29回 10/17/(金)
17:00〜		 新規ミトコンドリアβバレル型外膜タンパク質の網羅的探索 今井　賢一郎 (配列解析チーム)）
第28回 10/03/(金)
17:00〜		 ヒトゲノムの二次構造的アクセシビリティについて 木立　尚孝 (RNA情報工学チーム)
第27回 10/02/(木)
14:00〜		 質量分析法及び計算化学による糖鎖構造解析法 鈴木 宏明（東京大学大学院／分子機能計算チーム）
第26回 09/26/(金)
17:00〜		 バイオインフォマティクスにおける優れた推定量の設計方法 Designing superior estimators in Bioinformatics 浜田 道昭 （みずほ情報総研株式会社／RNA情報工学チーム）
第25回 09/25/(木)
14:00〜		 分子動力学シミュレーションに基づくConcavity shape fingerprintsとリガンド認識について 広川 貴次（創薬分子設計チーム）
第24回 09/19/(金)
14:00〜		 Data-mining and visualization in the post-genomic era: lessons from Ensembl and FANTOM4/GNP/ECW Jessica Severin (RIKEN Omics Science Center)
第23回 09/05/(金)
14:00〜		 大規模シーケンサーからの遺伝子発現情報解析 藤渕　航 (細胞機能設計チーム 研究チーム長)
第22回 09/04/(木)
14:00〜		 CASP8への取り組み（Disorder領域予測とドメイン予測） 野口 保（副研究センター長）
第21回 08/29/(金)
14:00〜		 A non-parametric Bayesian approach for predicting RNA secondary structures 佐藤 健吾 (RNAチーム)
第20回 08/28/(木)
14:00〜		 マルチプルアラインメントプログラムPRIMEの並列化 山田　真介（分子機能計算チーム）
第19回 08/22/(金)
14:00〜		 個別生細胞の動態解析のための情報処理 富永大介 (生体ネットワークチーム)
第18回 08/21/(木)
14:00〜		 Appropriate set of sequences for prediction of functional regions of a protein 根本　航（分子機能計算チーム）
第17回 08/01/(金)
14:00〜		 電子伝達蛋白質の立体構造・配列に基づくクラスタリング 長野 希美（細胞機能設計チーム）
第16回 07/29/(火)
14:00〜		 Transcriptional regulation shapes the organization of genes on both bacterial and eukaryotic chromosomes Sarath Chandra Janga(MRC Laboratory of Molecular Biology, University of Cambridge)
第15回 07/24/(木)
14:00〜		 タンパク質相互作用におけるディスオーダー予測とその解析 清水　佳奈（分子機能計算チーム）
第14回 07/18/(金)
14:00〜		 ポリグルタミン病の発病機構について 塚本 弘毅（分子機能計算チーム）
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回スケジュール タイトル発表者
第13回 07/17/(木)
14:00〜		 DisLex: a Transformation for Discontiguous Suffix Array Construction ホートン　ポール　(配列解析チーム)
第12回 07/11/(金)
14:00〜		 A local alignment model for non-coding RNA sequences and its application of local multiple alignment 田部井　靖生 （東京大学大学院・新領域創成科学研究科・情報生命科学専攻・浅井研究室)
第11回 07/10/(木)
14:00〜		 新レプリカ交換法RESTによる、蛋白質変性構造アンサンブルの解明 亀田倫史（創薬分子設計チーム）
第10回 07/04/(金)
14:00〜		 The functional RNA database version 3.0 and finding non-coding RNAs in the human genome 光山統泰　(RNAチーム)
第9回 07/03/(木)
14:00〜		 Influence of sequence and structure for understanding and predicting protein folding rates Michael Gromiha（分子機能計算チーム）
第8回 06/27/(金)
15:30〜		 タンパク質の凝集抑制法と難溶性分子への応用 白木賢太郎（筑波大学数理物質科学研究科 准教授）
第7回 06/27/(金)
14:00〜		 Semi-supervised Structured Output Learning for Giga-scale Data 鈴木潤（NTTコミュニケーション科学基礎研究所 研究員）
第6回 06/26/(木)
14:00〜		 タンパク質立体構造の評価関数の検討 本野 千恵（創薬分子設計チーム）
第5回 06/20/(金)
14:00〜		 ネットワーク構造変化の推定技術による細胞分化・発生及び疾患進展メカニズム解明の試み（本年度の目標） 堀本勝久（生体ネットワークチーム チーム長）
第4回 06/13/(金)
14:00〜		 GPCRファミリーの多様性（新規GPCR立体構造とその周辺） 諏訪　牧子　（主幹研究員）
第3回 06/05/(木)
14:00〜		 二次元物理・化学量出力を持つ隠れマルコフモデルによる膜タンパク質構造予測とその拡張 鏑木　崇史（早稲田大学　理工学術院　助手）
第2回 05/15/(木)
14:00〜		 Substructure Boosting Methods for Graphs, Sequences and Itemsets 津田宏治（Max Planck Institute for Biological Cybernetics）
第1回 05/08/(木)
15:00〜		 Applying machine learning techniques to Structural Bioinformatics: Applications and Results Dr. Jiangning Song
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