セミナー実績（2011年度）

回数の欄にリンク [HPCI] 表示があるセミナーは HPCIセミナー(2011/10/07〜2012/01/13)を兼ねており、
そのスケジュール・内容等はすべて公開されています。（誰でも聴講可） ＞＞　HPCIセミナー
・・・この印のついたセミナーは、どなたでも聴講可能な公開セミナーです。（事前申込不要）
会場への入室等、詳しい聴講方法はこちらをご覧ください。 ＞＞　聴講方法
・・・タイトルの後ろにこの印のついたセミナーは、英語による発表です。
回 スケジュール タイトル 発表者
第47回 03/29/(木)
11:00〜		 データの共有・再利用と「生命科学系データベースアーカイブ」 畠中　秀樹
（科学技術振興機構バイオサイエンスデータベースセンター）
第46回 03/23/(金)
14:00〜		 Transposon Tales: Genome-wide analyses unravel the story of their evolution Elizabeth Henaff
(Center for Research in Agricultural Genomics)
第45回 03/22/(木)
14:00〜		 X線結晶構造から観る無脊椎動物ロドプシンの光反応過程 村上　緑
（名古屋大学大学院理学研究科物理学教室　助教）
第44回 03/16/(金)
14:00〜		 RNA−タンパク質相互作用におけるRNA2次構造とタンパク質表面形状の役割 岩切　淳一
（宮崎大学　フロンティア科学実験総合センター）
第43回 03/15/(木)
16:00〜		 Finding speedup using data flow computing Michael Flynn
第42回 03/15/(木)
14:00〜		 木差分計算のソフトウェア進化解析への応用 森 彰
（産総研 社会知能技術研究ラボ 主任研究員）
第41回 03/05/(木)
10:30〜		 Combinatorial motif analysis of regulatory gene expression in Mafb deficient macrophages（Mafb欠損マクロファージにおける遺伝子発現制御の組合せモチーフ解析法） 森田 眞理子
（筑波大学大学院人間総合科学研究科生命システム医学専攻 ）
page top
回 スケジュール タイトル 発表者
第40回 03/02/(金)
14:00〜		 MixSIH: a mixture model for single individual　haplotyping 松本 拡高
（東京大学　木立研究室）
第39回 02/23/(木)
14:00〜		 Read error correction and Transcriptome analysis with High throughput sequencing data Hugues Richard
( Assistant professor, the University Pierre and Marie Curie )
第38回 02/16/(木)
14:00〜		 Draft genome analysis provides the design for producing highly neutral lipid in marine pennate diatom, *Fistullifera* sp. JPCC DA0580 田中 道廣
（細胞機能設計チーム）
第37回 02/10/(金)
14:00〜		 Evolutionary analysis of 3'UTR in the C.elegans genome.（線虫Caenorhabditis elegansゲノムの３’非翻訳領域の進化解析） 市原 寿子
（生体分子システム 研究班）
第36回 02/09/(木)
14:00〜		 Functional Modules in Druggable GPCR-GPCR interaction Network 根本　航
(分子機能計算チーム）
第35回 02/03/(金)
15:00〜		 Large-scale similarity search for noncoding RNAs using sequence kernels and locality-sensitive hashing 齋藤 裕
（慶應義塾大学 理工学部 生命情報学科 理工学研究科 基礎理工学専攻 生命システム情報専修）
第34回 01/20/(金)
14:00〜		 Tertiary structure prediction of RNA molecules using short single-stranded fragment structures 山崎 智
（分子機能計算チーム）
第33回 01/19/(木)
14:00〜		 Sequence Analysis of Outer Membrane Proteins of Mitochondria-related Organelle, Mitosome in E. histolytica 今井 賢一郎
（配列解析チーム）
第32回
[HPCI]		 1/13/(金)
14:45〜		 計算システム生物学的アプローチによる疾患要因遺伝子候補の絞り込み法 [Abstract PDF] 堀本 勝久
(生体ネットワークチーム)
Development of Infrastructure Technologies for Bioinformatics Information [Abstract PDF] 福井 一彦
(分子機能計算チーム)
第31回
[HPCI]		 12/16/(金)
14:45〜		 創薬インフォマティクスによる医薬品探索 [Abstract PDF] 広川 貴次
(創薬分子設計チーム)
Development of structure prediction pipeline for eukaryotic proteins and SAHG database [Abstract PDF] 本野 千恵
(創薬分子設計チーム)
page top
回 スケジュール タイトル 発表者
第30回 12/12/(月)
14:00〜		 ORTHOGONAL-RAY GRAPHS Anish Shrestha
(東京工業大学)
第29回
[HPCI]		 12/9/(金)
14:45〜		 遺伝子発現の時系列解析 [Abstract PDF] 富永 大介
(細胞機能設計チーム)
創薬技術としての分子動力学法 [Abstract PDF] 亀田 倫史
(創薬分子設計チーム)
第28回 12/7/(水)
15:00〜		 Quantification of circulating effects in input-output analysis 森岡 涼子
(機械学習研究班)
第27回
[HPCI]		 12/2/(金)
14:45〜		 遺伝子発現データからのネットワーク推定 [Abstract PDF] 油谷 幸代
(細胞機能設計チーム)
幹細胞インフォマティクスと創薬 [Abstract PDF] 藤渕 航
(細胞機能設計チーム)
第26回 11/30/(水)
15:00〜		 暗号プロトコルを用いたプライバシ保護データマイニング 荒井 ひろみ
（筑波大学 研究員）
第25回
[HPCI]		 11/25/(金)
14:45〜 		生体高分子の分子シミュレーション
- 計算機支援創薬にむけて - [Abstract PDF]		 末永 敦
(分子機能計算チーム)
第24回
[HPCI]		 11/18/(金)
14:45〜		 酵素の立体構造と触媒機能 [Abstract PDF] 長野 希美
(生体分子システム研究班)
高速検索技術のバイオインフォマティクスへの応用 [Abstract PDF] 津田 宏治
(機械学習班)
第23回
 11/14/(月)
14:00〜		 Single molecule manipulation of RNA under applied force: a quantitative approach to analyzing molecular tweezers experiments Wayne Dawson
(東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻)
第22回
[HPCI]		 11/11/(金)
14:45〜		 哺乳類ゲノムに保存されたRNA構造因子の網羅的探索 [Abstract PDF] 光山 統泰
(RNA情報工学チーム)
タンパク質発現・可溶性予測法とタンパク質ディスオーダー領域予測法 [Abstract PDF] 野口 保
(主幹研究員)
第21回 11/11/(金)
13:30〜		 リボソーム改変を起点とした微生物システムの解明 宮崎 健太郎
(産総研 生物プロセス研究部門 酵素開発研究グループ（北海道センター）)
page top 　
回 スケジュール タイトル 発表者
第20回
[HPCI]		 11/04/(金)
14:45〜		 Multiple Sequence Alignment [Abstract PDF] 加藤 和貴
（大阪大学 免疫学フロンティア研究センター 特任准教授）
Analysis of Protein-Protein Interaction with Multiple Amino Acid Sequence Alignment [Abstract PDF] 藤 博幸
（副研究センター長／生体分子システム研究班）
第19回
[HPCI]		 10/28/(金)
14:45〜		 All pairs similarity search in edit distance. [Abstract PDF] 清水 佳奈
(RNA情報工学チーム)
Cross profile analysis and its applications [Abstract PDF] 富井 健太郎
(配列解析チーム)
第18回 10/25/(火)
16:00〜		 Phenotype-specific network biology from data integration Soren Brunak
（デンマーク工科大学 教授）
第17回
[HPCI]		 10/21/(金)
14:45〜		 Pair-wise Sequence Comparison: Old and New Solutions [Abstract PDF] [Slide PDF] マーティン・フリス
(配列解析チーム)
第16回
[HPCI]		 10/14/(金)
14:45〜		 Perlによるfastq,fasta形式データの処理 [Abstract PDF] ポール・ホートン
(配列解析チーム)
嗅覚システムの統合的理解にむけて [Abstract PDF] 諏訪 牧子
(主幹研究員)
第15回 10/11/(火)
15:00〜		 Improving Gene Regulatory Networks Inference using Network Motifs with Time Course Expression Data Dave duVerle
(京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセン ター)
第14回
[HPCI]		 10/07/(金)　
16:00〜		 開講に当たって 浅井 潔 (CBRC 研究センター長／
東京大学大学院新領域創成科学研究科)
RNA 二次元構造の熱力学的エントロピーを計算するアルゴリズムについて [Abstract PDF] 木立 尚孝
(東京大学大学院新領域創成科学研究科)
Maximizing Expected Accuracy Estimations in Bioinformatics [Abstract PDF]

浜田 道昭
(東京大学大学院新領域創成科学研究科)
第13回 10/03/(月)
14:00〜		 Exploring the fold space of membrane proteins [Abstract PDF] Dmitrij Frishman
(Technische Universitaet Muenchen, Germany)
第12回 09/30/(金)
14:00〜		 ISMB/ECCB 2011参加報告 [Abstract PDF] 清水佳奈(RNA情報工学チーム)、富井健太郎(配列解析チーム)、ポール　ホートン(配列解析チーム)、本野千恵(創薬分子設計チーム)
第11回 09/02/(金)
14:00〜		 Next Generation Protein 3D Structure Analysis: Rapid Global/Local Surface Comparison, Docking and Low-Resolution Data [Abstract PDF] Daisuke Kihara
(Purdue University, USA)
page top
回 スケジュール タイトル 発表者
第10回 07/01/(火)
14:00〜		 SVRによる幹細胞の分化予測 千葉 啓和
(細胞機能設計チーム)
第9回 06/29/(水)
14:30〜		 Privacy Preserving Semi-Supervised Learning for Labeled Graphs [Abstract PDF] 荒井 ひろみ
(筑波大学 研究員)
第8回 06/24/(金)
14:00〜		 Next-generation genome alignment with LAST [Abstract PDF] Paul Horton
(配列解析チーム)
06/24/(金)
14:30〜		 SlideSort: Fast and exact algorithm for Next Generation Sequencing data analysis [Abstract PDF] 清水 佳奈
(RNA情報工学チーム)
第7回 06/23/(木)
15:00〜		 Probabilistic Models in Next-Gen Sequence Analysis [Abstract PDF] Timo Lassmann
(理化学研究所)
第6回 06/17/(金)
14:00〜		 Analysis of mitochondrial localizing mRNA [Abstract PDF] 崎山 則征
(配列解析チーム)
第5回 06/10/(金)
13:45〜		 microRNAによるターゲット遺伝子抑制効果をマイクロアレイデータから抽出する手法の開発 寺井 悟朗
(RNA情報工学チーム、株式会社インテック)
第4回 06/09/(木)
14:00〜		 Reverse engineering of genetic regulatory networks Jean-Francois Pessiot
(細胞機能設計チーム)
第3回 06/03/(金)
14:00〜		 Hadoopを用いた次世代シーケンサデータ解析システムの紹介 吉澤 亜耶
(分子機能計算チーム、株式会社インテック)
第2回 04/22/(金)
14:00〜		 個人情報の知識発見への応用とプライバシ保護 佐久間 淳
(筑波大学　准教授)
第1回 04/21/(木)
14:00〜		 アデノシン A2a 受容体と機能性抗体の共結晶構造 村田 武士
(千葉大学・理／JST・岩田ERATO)
page top