セミナー実績（2010年度）

回スケジュール タイトル発表者
第62回 03/11/(金)
14:00〜		 個人情報の知識発見への応用とプライバシ保護 佐久間 淳
(筑波大学 准教授　・ＪＳＴさきがけ)
第61回 02/10/(木)
14:00〜		 幹細胞インフォマティクスと未来創薬 藤渕 航
(細胞機能設計チーム）
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回スケジュール タイトル発表者
第60回 02/04/(金)
14:00〜		 Prediction of leucine-rich nuclear export signal containing proteins with NESsential Fu Szu-Chin
(配列解析チーム)
第59回 01/28/(金)
15:30〜		 コンピュータを使った創薬研究、分子モデリングによるタンパク質間相互作用の解析 小葦 泰治
(University of Maryland School of Pharmacy)
第58回 01/28/(金)
15:30〜		 化合物毒性による神経細胞関連遺伝子間ネットワークの変化 油谷 幸代
(細胞機能設計チーム)
第57回 01/20/(木)
15:30〜		 メタボローム技術で得られる代謝経路不明な多数の化合物の組み合わせから経路を予測する手法の開発 小寺 正明
(京都大学バイオインフォマティクスセンター)
第56回 01/20/(木)
14:00〜		 網羅的配列情報解析にもとづくＧタンパク質共役型受容体の構造分類 諏訪 牧子
(主幹研究員)
第55回 01/14/(金)
14:00〜		 真核生物ゲノムにおけるアシル基転移酵素多様性の解析(前半)
トランススクリトーム解析による心疾患病態遷移のモデル化(後半)		 田中 道廣
(京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター金久研究室 博士研究員)
第54回 01/13/(木)
14:00〜		 「GPUを用いた分子動力学法の高速化と省電力化」とSC10参加報告 関嶋 政和
(東京工業大学 国際学術情報センター 准教授)
第53回 12/16/(木)
14:00〜		 CASP9におけるPOODLE-Iの評価 野口 保
（主幹研究員）
第52回 12/09/(木)
14:00〜		 Discovering True Reads in NGS Data and Gene Finding in Metagenomic Sample Edward Wijaya
(配列解析チーム)
第51回 12/03/(金)
14:00〜		 Searching for similar protein-ligand binding sites at PDB scale 富井 健太郎
（配列解析チーム）
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回スケジュール タイトル発表者
第50回 12/01/(水)
14:00〜		 ゲノムスケールマルチプルアライメントからの進化情報抽出法について 木立 尚孝
（東京大学）
第49回 11/25/(木)
14:00〜		 DNAの4つ組み塩基配列の網羅的MDシミュレーションの結果から、タンパク質-DNA相互作用における間接認識(indirect readout)の寄与の大きさを評価する事は可能か？ 山崎 智
（分子機能計算チーム）
第48回 11/22/(月)
14:00〜		 多目的遺伝的アルゴリズムによるRNA配列解析 種田 晃人
(弘前大学大学院理工学研究科 助教)
第47回 11/19/(金)
14:00〜		 miRRim2: microRNA gene finder based on conditional random fields. 寺井 悟朗
（RNA情報工学チーム）
第46回 11/18/(木)
14:00〜		 酵素反応分類に基づく酵素反応予測 長野 希美
（生体分子システム研究班）
第45回 11/11/(木)
14:00〜		 Fast and accurate RNA structure prediction using integer programming 佐藤　健吾
（東京大学）
第44回 11/04/(木)
14:00〜		 In silico structure-based drug discovery for PPIs in chemical biology project 広川 貴次
（創薬分子設計チーム）
第43回 10/29/(金)
13:30〜		 A Procedure for Identifying Master Regulators in Conjunction with Network Screening and Inference 堀本 勝久
（生体ネットワークチーム）
第42回 10/28/(木)
14:00〜		 An introduction to glycome informatics methods 木下 フローラ 聖子
(創価大学工学部 大学院工学研究科 生命情報工学科 准教授)
第41回 10/22/(金)
14:00〜		 Sorting Next Generation Sequencing Data Improves Compression Effectiveness Raymond Wan
(東京大学、情報生命科学専攻)
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回スケジュール タイトル発表者
第40回 10/21/(木)
14:00〜		 An analysis of synonymous codon bias for mitochondrial proteins in Saccharomyces cerevisiae
酵母ゲノムのミトコンドリアタンパク質における同義コドン使用頻度の解析		 崎山 則征
（配列解析チーム）
第39回 10/15/(金)
15:30〜		 Rfam and Wikipedia: Using Wikipedia for community annotation Alex Bateman
(Sanger Institute)
第38回 10/15/(金)
14:00〜		 細胞データ解析に基づく細胞分化制御技術の開発 千葉 啓和
（細胞機能設計チーム）
第37回 10/14/(木)
14:00〜		 Stability and specificity of proteins and their complexes:energy based approach Michael Gromiha
（分子機能計算チーム）
第36回 10/07/(木)
15:30〜		 Model Checking: Automatic Verification of Complex Systems Paolo Zulian
(Carnegie Mellon University School of Computer Science)
第35回 10/07/(木)
14:00〜		 高速検索技術のバイオインフォマティクスへの応用 津田 宏治
（機械学習研究班）
第34回 10/06/(水)
15:00〜		 Progress in Membrane protein bioinformatics Arne Elofsson
( Prof. of Center for Biomembrane Research, Stockholm University)
第33回 10/01/(金)
14:00〜		 転写制御領域の配列データ解析 中井 謙太
（東京大学医科学研究所　教授）
第32回 09/30/(木)
14:00〜		 ISMB2010　参加報告 本野 千恵
（創薬分子設計チーム）他
第31回 09/17/(金)
14:00〜		 短い時系列データにおける周期性検出アルゴリズムとその実装 富永 大介
（細胞機能設計チーム）
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回スケジュール タイトル発表者
第30回 09/16/(木)
14:00〜		 シミュレーションから熱力学量を正しく求めるのに重要な量：圧力 亀田　倫史
（創薬分子設計チーム）
第29回 09/10/(金)
14:00〜		 プレ配列プロテオームデータを用いたミトコンドリア・マトリックス移行シグナルと切断部位の予測 今井 賢一郎
（配列解析チーム）
第28回 09/09/(木)
14:00〜		 類似文字列ペア列挙法を用いた時系列データからのモチーフ抽出 森岡　涼子
（機械学習班）
第27回 09/03/(金)
14:00〜		 A Large-scale Sequencing of Small (40-100 nt) RNA Transcripts from Mouse Brain and Transfer RNA Expression Profiling 光山 統泰
（RNA情報工学チーム）
第26回 09/02/(木)
14:00〜		 プロファイル比較のタンパク質機能部位解析への応用 藤 博幸
（生体分子システム研究班）
第25回 08/27/(金)
14:00〜		 記号計算手法による高精度数値最適化 中津井　雅彦
（生体ネットワークチーム）
第24回 08/26/(木)
14:00〜		 タンパク質複合体の会合状態を比較解析するプログラムの開発 根本 航
(分子機能計算チーム)
第23回 08/06/(金)
14:00〜		 Coevolution of interacting proteins: What is behind the mirror tree? Maricel G Kann
( Asst. Prof., University of Maryland, Baltimore County)
第22回 08/05/(木)
14:00〜		 Predicting drug-target interaction networks from the integration of chemical, genomic and pharmacological spaces 山西 芳裕
(1; Mines de ParisTech, Centre for Computational Biology 2; Institut Curie, Department of Bioinformatics and Computational Systems Biology of Cancer)
第21回 07/22/(木)
14:00〜		 What's wrong with homology search and how to fix it Martin Frith
(配列解析チーム)
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回スケジュール タイトル発表者
第20回 07/15/(木)
15:30〜		 Construction and Analysis of Genome-wide SNPs Networks Michael K. Ng
Centre for Mathematical Imaging and Vision and Department of Mathematics Hong Kong Baptist University, Professor
第19回 07/08/(木)
14:30〜		 New structural phylogenomic methods for protein function prediction Kimmen Sjolander
Berkeley Phylogenomics Group, University of California, Berkeley
第18回 06/25/(金)
14:00〜		 Improved Prediction of Transcription Binding Sites from Chromatin Modification Data Paul Horton
(配列解析チーム)
第17回 06/24/(木)
14:00〜		 Pushing the frontiers of atomic models for folding and Jayaram B
(Indian Institute of Technology Delhi, India Professor)
第16回 06/11/(金)
15:00〜		 刺激に反応するパスウエイと副作用の同定に向けて 瀬々 潤
(お茶の水女子大学大学院　准教授)
第15回 06/10/(木)
16:00〜		 タンパク質発現系におけるタンパク質可溶化に向けた技術開発 廣瀬 修一
第14回 06/10/(木)
14:00〜		 USING GRAPH PROPERTIES TO IDENTIFY FUNCTIONAL DOMAINS IN PROTEIN STRUCTURES Ugur Sezerman
(Sabanci University, TURKEY)
第13回 06/04/(金)
14:00〜		 Possible reduction of the fidelity of DNA polymerase delta in the mammalian and avian lineages 加藤 和貴
(RNA情報工学チーム)
第12回 06/03/(木)
16:00〜		 古細菌代謝の再構築―形成・環境適応機構の理解に向けて 竹本 和広
(科学技術振興機構さきがけ)
第11回 06/02/(水)
14:00〜		 Towards Network Systems Biology Luonan Chen
(Shanghai Institutes for Biological Sciences Chinese Academy of Sciences,Executive Director, Professor)
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回スケジュール タイトル発表者
第10回 06/01/(火)
15:00〜		 音声認識研究の紹介とタンパク質3 次元構造予測への応用 篠崎 隆宏
(東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻 助教)
第9回 05/31/(月)
15:00〜		 New machine learning algorithms applicable to bioinformatics problems 加藤 毅
(東京大学大学院新領域創成科学研究科 特任准教授)
第8回 05/31/(月)
13:30〜		 インフルエンザウイルスの受容体認識機構の解析およびそれを応用した受容体結合阻害剤の開発 尾曲 克己
(名古屋市立大学大学院医学研究科ウイルス学 助教)
第7回 05/31/(月)
10:00〜		 相同配列と立体構造を利用したタンパク質機能部位予測 根本 航
(分子機能計算チーム)
第6回 05/28/(金)
14:00〜		 細胞分化解析を目指した網羅的ヒト細胞データベース「CELLPEDIA」 幡野 晶子
(細胞機能設計チーム)
第5回 05/27/(木)
14:00〜		 Molecular Dynamic Simulations of Nuclear Receptors Sofia Burendahl
(創薬分子設計チーム)
第4回 05/21/(金)
14:00〜		 All Pairs Similarity Search in Edit Distance 清水 佳奈
(RNA情報工学チーム)
第3回 05/20/(木)
15:00〜		 Computational Analysis of SAMPs (ubiquitin-like Small Archaeal Modifier Proteins) 市原　寿子
(生体分子システム研究班)
第2回 05/14/(金)
14:00〜		 Distance learning with PARCA Jean-Francois Pessiot
(細胞機能設計チーム)
第1回 04/16/(金)
14:00〜		 The Relevant-Set Correlation Model for Data Clustering Michael E. Houle
(Visiting Professor, National Institute of Informatics)
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