ゲノム情報研究センター[CBRC]

CBRC出展概要

CBRCでは口頭発表3件、ポスター7点を展示し、内容の説明を致します。
CBRC出展概要についてのお問い合わせは、こちらまでご連絡ください。

口頭発表

日時：10月14日（木）
時間：13時〜15時、16時15分〜17時
場所：産総研つくば中央第6コア会場(体育館)

ポスター展示

日時：10月14日（木）・15日（金）
時間：10時00分〜17時（15日（金）は〜16時30分）
場所：産総研つくば中央第6コア会場(体育館)

CBRC出展ブース（産業技術総合研究所（AIST)ブース内 ）

【パネル発表】
ライフサイエンス統合DBプロジェクト：ワークフローによるゲノム・分子情報解析

ライフサイエンス研究分野では、その細分化や専門家に伴い、様々なデータベース、解析ツール予測ソフトウェアが開発され膨大な数に達しており、これらを有効かつ効率よく利用するには様々な課題を克服する必要があります。生命情報工学研究センター（CBRC）では、文部科学省のライフサイエンス統合データベースプロジェクトに参画し、これら分散するソフトウェア解析やデータベース検索等を、一つ一つユーザが実行するのではなく、一連の処理の流れを定義することにより、効率的に短時間に実行するためのワークフローに関する技術開発を進め、統合化を目指した実用的な情報基盤開発に取り組んでいます。
連絡先：分子機能計算チーム　福井 一彦
■パネルPDF

【パネル発表】
次世代シークエンサによる大規模転写産物解析の自動アノテーションシステム：GIGANT

次世代シークエンサの技術革新が目覚ましい昨今、シークエンサーから出力される大量配列情報をいかに処理して解析するかが問題となっている。解析には計算機による情報処理が不可欠だが、一般的な実験系研究室では、情報解析を適切に実施できる研究者・技術者が皆無、あるいは不足していることが主な要因である。我々は、この問題への解決策を提供するため、次世代シークエンサーからの転写産物の配列情報を入力として受け取ると、個々の配列に自動的に自動的にアノテーション情報を付与するシステムを構築した。
連絡先：RNA情報工学チーム　光山 統泰
■パネルPDF

【口頭発表】産総研アカデミックシーズ発表会

CBRC発表概要

CBRCは来る9月26日〜28日、早稲田大学 国際コミュニティセンターに於いて開催されるInCob 2010にスポンサーとして参加。ブースを出展すると共に、2名の研究者が口頭発表します。

CBRC2010について:

バイオインフォマティクス分野の多様なテーマで研究を進めている生命情報工学研究センター（CBRC）は毎年ワークショップを開催しています。 本年度ワークショップ（CBRC2010）では、研究成果をソフトウェアデモンストレーション、口頭発表、ポスターセッションの３つの形式による発表と、 国内外の著名な研究者による招待講演を行ないます。CBRC研究活動の全体像を捉えると共に、研究者と直接活発な議論ができる場を提供します。

BiWO2010について:

7月28日〜30日、Bioinformatics Week in Odaiba (BiWO2010) と称し、 5つのバイオインフォマティクス関連の会議をお台場産総研にて連続開催致します。

CBRC口頭発表

　CBRCは来る7月11日〜13日に米国マサチューセッツにて開催されるISMB2010にゴールドスポンサーとして参加します。CBRCからは5名の研究者が最新の研究成果を口頭発表・ポスター発表します。

【テクノロジートラック: TT14】　7月11日（月）10:45-11:10

Title:"Challenging algorithms and comprehensive databases in protein structure and function"
Room :306
Presenting author: Michael Gromiha, CBRC, AIST, Japan
Abstract:
We have developed comprehensive databases and competitive algorithms for understanding the structure and function of proteins. Our methods include (i) prediction of protein subcellular localization, transmembrane proteins/segments, disordered proteins/regions, and protein tertiary structures. Major databases are enzyme catalytic mechanisms, membrane protein function and structural atlas of human genome.
Abstract PDF:http://www.iscb.org/uploaded/css/56/18506.pdf
Presentation PDF:http://www.cbrc.jp/ja/result/pdf/ISMB2010_TT14.pdf

【テクノロジートラック: TT16】　7月11日（月）11:15-11:40

Title:"Software for RNA and Next-gen Sequencer Analysis"
Room :306
Presenting author: Paul Horton, Computational Biology Research Center, AIST, Japan
Abstract:We introduce several new computational methods for the next-gen sequencer age. RECOUNT corrects tag abundance. LAST is a faster replacement for BLAST. CentroidFold predicts RNA 2' structure, fRNAdb holds information on functional RNA's, and miRRim predicts miRNA foldbacks.
Abstract PDF:http://www.iscb.org/uploaded/css/56/18528.pdf
Presentation PDF:http://www.cbrc.jp/ja/result/pdf/ISMB2010_TT16.pdf

CBRC発表概要

国際バイオEXPOと併催される国際バイオフォーラムにおいて、以下5名の研究者が最新の研究
成果を発表いたします。 是非、口頭発表会場、CBRCパビリオンへお立ち寄りください。

面談をご希望の方、招待状をご入用の方はお気軽にお問い合わせください。
CBRC事務局:

　内　容　

お台場での研究生活について

研究室紹介　　於：8階コラボレーションコーナー

14:00-14:05 ご挨拶　Paul Horton

14:05-14:25 お茶の水女子大学大学院
人間文化創成科学研究科
教授：由良敬
客員教授：諏訪牧子
客員准教授：油谷幸代

14:25-14:50 東京大学大学院
新領域創成科学研究科情報生命科学専攻
教授：浅井潔、准教授：木立尚孝
客員准教授：富井健太郎、広川貴次、ポール・ホートン
農学生命科学研究科応用生命工学専攻
特任教授：諏訪牧子

14:50-15:05 東京医科歯科大学大学院
生命情報科学教育部
客員准教授：広川貴次、藤渕航、光山統泰

15:05-15:30 早稲田大学大学院 基幹理工学研究科
バイオインフォマティクス特論
客員教授：藤博幸、野口保、諏訪牧子、福井一彦
客員准教授：藤渕航、本野千恵、富永大介、清水佳奈

15:30-15:45 奈良先端科学技術大学院大学
情報科学研究科生体分子情報学講座
客員教授：上野豊、福井一彦
＞研究室案内はこちら

15:45-15:55　施設見学

15:55-17:00　個別相談　於：8階リフレッシュコーナー

クリックするとオリジナルが開きます。(725KB)

情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンターと共催

　大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター（DBCLS）では、文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」において国内の分散した生命科学関連のリソースを整備・統合するために、様々な試みを行っています。
　この一環として、国内外の生命科学データやサービスの統合化のために国際開発会議「DBCLSバイオハッカソン (BioHackathon)2010」を開催します。(主催：DBCLS、 共催：独立行政法人 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター (CBRC))。それに先立ち、2010年2月8日(月)には、CBRCにて生命科学におけるデータ統合化の取り組み、特にセマンティックウェブ技術の利用と応用について紹介するシンポジウムを開催いたします。本シンポジウムでは、議論を深めるためのポスターセッションなども企画しています。