ゲノム情報研究センター[CBRC]

Tomii, K., Ota, M., Noguchi, T., Akiyama, Y.: "PILOT: a Fold Recognition Server Based on PSI-BLAST, IMPALA and Libra-Rotamer", CASP5, pp.A-122 (2002).
Tomii, K., Akiyama, Y.: "Fold Recognition Using the FORTE1 Server", CASP5, pp.A-61 - A-62 (2002).
Tomii, K., Hirokawa, T., Noguchi, T., Suenaga, A., Akiyama, Y.: "Integrating a New Fold Recognition Method with an Exhaustive Molecular Modeling System: FORTE1 and FORTE-SUITE", CASP5, pp.A-37 (2002).
藤博幸, 富井健太郎: "相同配列比較解析による構造・機能情報の抽出", ポストシークエンスタンパク質実験法１全タンパク質の解析 (2002).
Uedaira, H., Prabakaran, P., Gromiha, M.M., Kitajima, K., Sarai, A.: "Progress of ProNIT: Thermodynamic database for protein-nucleic acid interactions", Genome Informatics, 13, pp.502-503 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
Baca, K.A., Gromiha, M.M., Yebaira, H., Kitajima, K., Sarai, A.: "Recent developments in ProTherm: Thermodynamic database for proteins and mutants", Genome Informatics, 13, pp.500-501 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
Gromiha, M.M., Selvaraj, S.: "Importance of Long-range Interactions for Determining the Folding Rate and Transition State Structures of Two-state Proteins", Genome Informatics, 13, pp.348-349 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
Ahmad, S., Gromiha, M.M., Sarai, A.: "Prediction of DNA binding in proteins from composition, sequence and structure", Genome Informatics, 13, pp.308-309 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
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Sarai, A., Selvaraj, S., Gromiha, M.M., Siebers. J.G., Prabakran, P., Kono, H.: "Target prediction of transcription factors: application of structure based method to yeast genome", Genome Informatics, 13, pp.305-307 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
Gromiha, M.M., Ahmad, S., Suwa, M.: "An Efficient Method for Predicting the Membrane Spanning β-strands in Outer Membrane Proteins", Proc. Bioinformatics in the post-genomic era, pp.65 (2002).
Uedaira, H., Gromiha, M.M., Prabakaran, P., Kiajima, K., Sarai, A.: "Development and application of ProNIT: Thermodynamic database for protein-nucleic acid interactions", Proc. Biophys. Soc. Japan, 42, pp.S77 (2002).
Sarai, A., Gromiha, M.M., Selvaraj, S., Siebers, J., Kono, H.: "Specificity of Protein-DNA Recognition and Target Prediction of Transcription Factors in Yeast Genome", Proc. Biophys. Soc. Japan, 42, pp.S77 (2002).
Ahmad, S., Gromiha, M.M., Sarai, A.: "Real Value Prediction of Accessible Surface Area in Proteins", Proc. Biophys. Soc. Japan, 42, pp.S54 (2002)
Bava, A., Gromiha, M.M., Uedaira, H., Kitajima, K., Sarai, A.: "Recent Developments in ProTherm: Thermodynamic database for proteins and mutants", Proc. Biophys. Soc. Japan, 42, pp.S48 (2002).
福井一彦: "ペプチド切断の質量分析計による解析", AIST Today, 2(10), pp.15 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
津田宏治: "カーネル設計の方法", NEURAL NETWORKS, 9(3), pp.190-195 (2002).
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福田賢一郎: "生命科学知識の形式的記述－シグナル伝達パスウェイデータベースの構築", AIST Today, 2(9), pp.19 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
上野豊, 浅井潔, 高橋勝利, 佐藤主税: "電子顕微鏡によるタンパク質立体構造の単粒子解析", 日本物理学会会誌, 57(8), pp.568-574 (2002).
Akinori Sarai, Michael Gromiha, Shandar Ahmad, J. Siebers: "生体分子統合データベースの構築", Proc. 特定領域研究「ゲノム」4領域, pp.160 (2002).
Gromiha, M.M., Ahmad, S., Suwa, M.: "An efficient method for predicting the membrane spanning beta strands", Proc. ISMB2002, 2001(110), pp.13-18 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)/閲覧にはオンラインジャーナルの契約等が必要です。
長野希美: "配列・立体構造・機能に基づく酵素スーパーファミリーの系統的解析 -TIMバレル型糖加水分解酵素（Glycosidase）スーパーファミリーへの応用", AIST Today, 2(7), pp.17 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
Shandar Ahmad, Michael Gromiha, Akinori Sarai: "Identification of residues with high solvent accessibility in proteins", 日本蛋白質科学会年会, pp.108 (2002).
Michael Gromiha, Motohisa Obatake, Hidetoshi Kono, Hatsuho Uedaira, Akinori Sarai: "Relationship between amino acid properties and protein stability upon surface mutations: analysis and prediction", 日本蛋白質科学会年会, pp.64 (2002).
野口保: "PDB代表タンパク質チェイン決定システム -タンパク質立体構造研究への応用-", AIST Today, 2(6), pp.15 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
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津田宏治, 杉山将, Klaus-Robert Mueller: "モデル選択規準SICのスパース回帰分析への適用", 電子情報通信学会論文誌, J85-DⅡ(5), pp.766-775 (2002).
後藤修: "ホモロジーを用いた遺伝子構造予測－その薬物代謝酵素遺伝子への応用－", AIST Today, 2(3), pp.10 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。 ■PubMed
Fushimi, Y., Aita, T., Taubuchi, I.: "Correlated flexible molecular coding and molecular evolvability", Journal of Biological Physics, 28(3), pp.499-507 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)/閲覧にはオンラインジャーナルの契約等が必要です。
後藤修: "配列のホモロジーと統計情報を併用した真核生物遺伝子構造の予測", 統計数理, 50(1), pp.3-15 (2002). ■ジャーナルサイトのFull Text Paper(PDF)／どなたでもご覧になれます。
秋山泰: "生命情報科学研究センターとバイオインフォマティクス研究", ゲノム医学, 2(1), pp.67-72 (2002).
福田賢一郎: "シグナル伝達と仮説推論", 電子情報通信学会技術研究報告, 102(91), pp.61-66 (2002).

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ゲノム情報研究センターではゲノム情報を活用するバイオインフォマティクス研究開発を行なっています。

論 文（誌上発表・査読無し：2002年）

論　文（誌上発表・査読無し：2002年）