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  • 論文（口頭発表：2010年）

論　文（口頭発表：2010年）

  • Horton, P.: "Sequence Analysis of Mitochondrial Outer Membrane Proteome", BGI seminar, China, 23rd Dec. 2010.
  • Horton, P., Wijaya, E., PessiotJ-F.K., Frith, M., Fujibuchi, W., Asai, K.: "In Search of True Reads: A Classification Approach to Next Generation Sequencing Data Selection", BIBM 2010, Workshop on Data-mining of Next-Generation Sequencing Data, Hong Kong, China, 20th Dec. 2010
  • Wan, R., Asai, K.: "Sorting Next Generation Sequencing Data Improves Compression Effectiveness", BIBM 2010 Workshop on Data-Mining of Next Generation Sequencing Data, Hong Kong, China, 20th Dec. 2010
  • Hirokawa, T.: ”In silico screening for protein-protein interaction inhibitors”, AHeDD Symposium 2010, Yonsei University, Korea, 18th Dec. 2010.
  • 富永 大介: "Optimal modeling method for small sample time series data for detection of state transition of cells", 第23回バイオ情報学研究会, 福岡, 2010年12月17日
  • Katou, T., Suwa, K., Nagano, N.: "Parametric Templates: A New Enzyme Active-Site Prediction Algorithm", In conjunction with the 10th IEEE International Conference on Data Mining (ICDM 2010) Biological Data Mining and its Applications in Healthcare, Sydney, Australia, 14th Dec. 2010.
  • Fukui, K.: "Bilateral Bioinformatics Research in Protein Engineering: Modeling, Analysis andSimulation", 4th India (DBT)-Japan (AIST) WS, IIT, Delhi, India, 13rd Dec. 2010.
  • 深沢 嘉紀, Wan Raymond, 傅 思縉, 辻 淳子, 崎山 則征, 今井 賢一郎, Horton Paul, "MoiraiSP: a novel mitochondrial cleavage site predictor", 2010年JSBi年会（CBI学会・JSBi 合同大会）神戸, 2010年12月
  • Shimizu, K.: "Functional analyses of intrinsic disorder from the view point of a protein-protein interaction network", 2nd Indo-Japan Symposium on Bioinformatics, Delhi, India, 10th Dec. 2010.
  • Fukui, K.: "Recognition Mechanism for Biomolecular Complexes using Grid computing", 2nd Indo-Japan Symposium on Bioinformatics, Delhi, India, 10th Dec. 2010.
  • 藤渕 航: ”情報解析と未来医療−癌やES細胞を用いた薬効予測と治療指針システムの設計”, セラノスティクスプラットフォーム勉強会, 東京, 2010年12月3日.
  • 長野 希美: "酵素反応分類に基づく酵素反応予測システムの開発", JST-BIRD　第6回成果報告会, 東京, 2010年11月10日
  • Suwa, M.: ”Seven transmembrane helix receptors(7TMR) identified from silkworm Genome”, International Symposium, New Silk Road: SilkwormGenome to Susteinable Agriculture., Tukuba, 9th Nov. 2010.
  • 堀本 勝久: ”システム生物学的アプローチによる合目的的ネットワーク数理解析法の開発”, 平成22年度セルイノベーション公開セミナー 「次n世代シーケンサーの急速な発展と生命科学への活用」, 東京, 2010年11月3日.
  • 広川 貴次: ”単体および複合体タンパク質を標的としたインシリコスクリーニング”, 構造活性相関シンポジム, 徳島, 2010年10月30日.
  • 広川 貴次: ”タンパク質-タンパク質間相互作用を標的としたインシリコ解析”, JBIC2010プロジェクト研究成果報告会, 東京, 2010年10月29日.
  • 諏訪 牧子: ”ゲノム情報から探るＧタンパク質共役型受容体（ＧＰＣＲ）の構造・機能空間”, アグリバイオインフォマティクス教育プログラムシンポジウム, 東京, 2010年10月22日.
  • 福井 一彦: "KNIMEによるライフサイエンス情報統合ワークフロー", 第一回ＫＮＩＭＥワークショップ, 東京, 2010年10月19日
  • Kato, Y., Sato, K., Hamada, M., Watanabe, Y., Asai, K., Akutsu, T.: "RactIP: fast and accurate prediction of RNA-RNA interaction using integer programming", ECCB10, Ghent, Belgium, 27th Sep. 2010.
  • 斉藤　裕、佐藤 健吾、榊原 康文: ”Robust and accurate prediction of noncoding RNAs from aligned sequences”, International Conference on Bioinformatics (InCoB), 東京, 2010年9月27日.
  • Fukui, K.: "Life Science Integrated DB Project: Development of Web and Active Workflow", International Conference on Bioinformatics (InCoB), Tokyo, 26th Sep. 2010.
  • Imai, K., Nakai, K., "Prediction of subcellular locations of proteins: where to proceed?", International Conference on Bioinformatics (InCoB), Tokyo, 26th Sep. 2010.
  • Tominaga, D.: "Periodicity Detection Method for Small Sampled Time Series Data of Gene Expression Levels", CBI 2010, Kobe, 17th Sep. 2010.
  • 藤渕 航: "創薬研究におけるCBRCのデータベースと解析ソフトウェアの活用", 平成22年度　第一回データベース講習会＠お台場, 産総研・臨海副都心センター, 2010年9月14日
  • Gromiha, M.M.: "Functional analysis of membrane proteins and their complexes", Special seminar, University of Madras, India, 7th Sep. 2010.
  • 渡邊真也、久須田樹哉、施建明、Horton Paul: "データ分布に基づく階層型多クラス分類を用いた蛋白質の細胞内局在部位予測", 第９回情報科学技術フォーラム, 九州大学, 2010年9月7日
  • Gromiha, M.M.: "Recognition mechanism of protein complexes and stability of protein mutants", Special seminar, Bharathidasan University, Tiruchirapalli, India, 6th Sep. 2010.
  • 堀本 勝久: ”Two methods for network analysis inspired by the collaboration with experimental biologists”, 第3回若手研究者セミナー日本学術振興会アジア研究教育拠点事業「微生物の潜在能力と次世代発酵技術の構築」, 山口, 2010年9月5日.
  • 富井 健太郎, : ”異種プロファイル比較から見えること”, 計算タンパク質科学研究会2010年度勉強会, 兵庫, 2010年9月5日.
  • Gromiha, M.M.: "Stability and Specificity of Protein-Carbohydrate Complexes", Special seminar, National Chemical Laboratory, Pune, India, 31st Aug. 2010.
  • 藤渕 航: "バイオインフォマティクスの概観", 早稲田大学先進理工学部生命医科学科講演会, 早稲田大学, 2010年8月27日
  • 堀本 勝久: ”システム生物学におけるネットワーク解析の精度向上”, JWEINシンポジウム, 東京 , 2010年8月21日.
  • Gromiha, M.M., Selvaraj, S., Jayaram, B.Fukui, K.: "Identification and analysis of binding site residues in protein complexes: energy based approach", International Conference on Intelligent Computing, Changsha, China, 20th Aug. 2010.
  • Chen, S-A., Ou, Y-Y.Gromiha, M.M.: "Topology Prediction of alpha-helical and beta-barrel Transmembrane Proteins using RBF Networks", International Conference on Intelligent Computing, Changsha, China, 20th Aug. 2010.
  • Nakatsui, M., Sedoglavic, A., Lemaire, F., Boulier, F., Urguplu, A, Horimoto, K.: ”A General Procedure for the Accurate Parameter Estimation in Dynamic Systems Using New Estimation Errors”, Algebraic and Numeric Biology, Austria, 1st Aug. 2010.
  • Tominaga, D.: "Fourier Based Periodicity Detection Method for Short Length Time Series Data", CBRC2010, CBRC, 30th Jul. 2010.
  • Katou, T., Nagano, N.: "Metric-learning based active site prediction for enzyme proteins", CBRC2010, CBRC, 30th Jul. 2010.
  • Yamasaki, S., Nakamura, S., Fukui, K.: "Attempts to predict RNA tertiary structures using fragment structural library based on secondary structures.", CBRC2010, CBRC, 28th Jul. 2010.
  • 加藤 和貴、藤 博幸: ”Two extensions of MAFFT: protein structure-sequence alignment and large-scale sequence alignment”, the annual CBRC open house workshop, Tokyo, 28th Jul. 2010.
  • 広川 貴次: ”タンパク質構造情報に基づく創薬分子設計”, アグリバイオインフォマティクス教育研究ユニットセミナー, 東京, 2010年7月12日.
  • Gromiha, M.M., Motono, C., Horton, P., Tomii, K., Nagano, N., Shimizu, K., Asai, K.: "Challenging algorithms and comprehensive databases in protein structure and function", ISMB, Boston, USA, 11st Jul. 2010.
  • 藤渕 航: "細胞形態と遺伝子ネットワークによる細胞状態の最先端情報解析法", バイオアカデミックフォーラム, 東京, 2010年7月2日
  • 野口 保: "タンパク質発現・可溶性予測法の開発", 第１０回国際バイオEXPO, 東京, 2010年7月1日
  • 広川 貴次, : ”ケミカルバイオロジーPJにおけるインシリコ解析の役割”, 第9回　国際バイオEXPO, 東京, 2010年6月30日.
  • 加藤 毅、諏訪和大、長野 希美: "計量学習による酵素活性部位予測", 第21回 情報処理学会 バイオ情報学研究会 (SIG-BIO), 琉球大学, 2010年6月19日
  • 根本 航、福井 一彦、藤 博幸: ”Gタンパク質共役型受容体間相互作用の制御に向けたバイオインフォマティクスによるアプローチ”, 日本蛋白質科学会, 札幌, 2010年6月18日.
  • 清水 佳奈、藤 博幸: "天然変性タンパク質の相互作用の網羅的解析", 第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年6月16日
  • 藤渕 航: "情報工学の医療への応用の最前線", GIリサーチフォーラム, 仙台, 2010年6月9日
  • 藤 博幸: ”タンパク質のバイオインフォマティクス　- 機能構造と分子進化”, 第20回感染研シンポジウム, 東京, 2010年5月21日.
  • Horton, P.: " ", ACFAS第78回年大会, Montreal, Canada, 10th May 2010.
  • 根本 航、福井 一彦、藤 博幸: "Gタンパク質共役型受容体オリゴマー研究へのバイオインフォマティクスによるアプローチ", GPCR研究会, 東京, 2010年5月7日
  • Sato, K., Whitington, T., Bailey, T.L., Horton, P.: "Improved Prediction of Transcription Binding Sites from Chromatin Modification Data", IEEE CIBCB 2010, Montreal, Canada, 5th May 2010.
  • 堀本 勝久: ”エピゲノム解析におけるシステム生物学の貢献可能性”, ゲノムテクノロジー第164委員会第33回研究会, 東京, 2010年4月30日
  • Wan, R.: "HAMSTER: Visualizing microarray experiments as a set of minimum spanning trees", seminar series, Chinese University of Hong Kong, 26th Apr. 2010.
  • Horitomo, K.: ”Network Screening Based on Graphical Gaussian Model”, CSB Seminar Series 2010, Suzhou University, China, 20th Apr. 2010.
  • 堀本 勝久: ”幹細胞標準化におけるシステム生物学の貢献”, 産総研ライフサイエンス分野シンポジウム, 東京, 2010年4月16日.
  • 堀本 勝久: ”ネットワーク・スクリーニング：RNAi実験を活用した活性化ネットワーク探索技術”, CBI学会研究講演会「RNA創薬への道」, 東京, 2010年4月12日.
  • Gromiha, M.M.: "Comparative analysis of binding site residues in protein-protein and protein-RNA complexes", Special seminar, Manonmanium Sundaranar University, India, 29th Mar. 2010.
  • 広川 貴次: "分子モデリング技術によるGPCR-リガンド複合体予測", 日本薬学会第130年会, 就実大学, 2010年3月28日
  • Fukui, K.: "Binding analysis for protein-carbohydrate", Special seminar , Manonmanium Sundaranar University, India, 26th Mar. 2010.
  • Gromiha, M.M.: "Database development, text mining and functional analysis of olfactory receptors", Special seminar, National Center for Biological Sciences, Bangalore, India, 24th Mar. 2010.
  • Horton, P.: "Getting traction in a wet-lab world; A case study from proteome sequence analysis", ACM SAC2010, Sierre, Switzerland, 24th Mar. 2010.
  • Fukui, K.: "Molecular Simulation for membrane protein", Special seminar, National Center for Biological Sciences, Bangalore, India, 24th Mar. 2010.
  • Gromiha, M.M.: "Binding site analysis and recognition mechanism in protein-protein and protein-RNA complexes: energy based approach", Special seminar, IIT Delhi, India, 22nd Mar. 2010.
  • Fukui, K.: "Protein-Protein interaction analysis using molecular modelling and docking calculation", Special seminar, IIT Delhi, India, 22nd Mar. 2010.
  • Nemoto, W., Fukui, K., Toh, H.: "Bioinformatics Approaches toward Controlling Protein-Protein Interaction between GPCRs", PepCon-2010, Beijing, China, 21st Mar. 2010.
  • Horton, P.: "Software and Algorithms for Next-gen sequencing and beyond", Seminar Series, Munich, Germany, 19th Mar. 2010.
  • Horton, P.: "Software and Algorithms for Next-gen sequencing and beyond", seminar series, Munich, Germany, 18th Mar. 2010.
  • 清水 佳奈: "タンパク質間相互作用ネットワークにおけるディスオーダーの解析", 第24回膜生物学グローバルCOE学術講演会, 神戸大学, 2010年3月12日
  • 幡野 晶子、MOESA Amri Harry、千葉 啓和、谷口　丈晃、永家　聖、山根木 康嗣、藤渕 航: "細胞分化解析を目指した網羅的ヒト細胞データベース「CELLPEDIA」", 第20回バイオ情報学研究発表会, 北陸先端科学技術大学院大学, 2010年3月5日
  • 金 ｻ尢驕A加藤 毅、茂櫛薫、田中博、藤渕 航: "正則化正準相関解析を用いた抗がん剤の影響による共通パスウェイ解析", バイオ情報学研究会, 北陸先端科学技術大学院大学, 2010年3月5日
  • 富井 健太郎: "情報科学的手法とタンパク質立体構造予測", 第５回生体分子システムの物理科学研究センター研究会, 大阪, 2010年2月27日
  • Horton, P.: "Software and Algorithms for Next-gen sequencing and beyond", seminar series, 台湾、台北市、中央研究院, 26th Feb. 2010.
  • Horton, P.: "Software and Algorithms for Next-gen sequencing and beyond", Special Seminar, 台湾、台北市、陽明大学, 25th Feb. 2010.
  • Horton, P.: "Software and Algorithms for Next-gen sequencing and beyond", 台湾大学生科系演講, 台湾、台北市, 24th Feb. 2010.
  • Horton, P.: "Software and Algorithms for Next-gen sequencing and beyond", 清雲科技大學セミナー, 台湾, 22nd Feb. 2010.
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