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  • 論文(口頭発表:2011年)

論 文(口頭発表:2011年)

  • 清水 佳奈, "次世代シークエンスデータの高速解析技術の開発", 次世代シーケンシングが切り開く医学研究と展望, 京都大学, iPS研究所, 2011年12月14日
  • 深沢 嘉紀, "傅 思縉, "辻 淳子, "崎山 則征, "今井 賢一郎, "Horton Paul, "MoiraiSP: a novel mitochondrial cleavage site predictor", Bioinformatics 2012, Stockholm, Sweden, 2011年12月14日
  • 辻 淳子, Frith Martin, 富井 健太郎, Horton Paul, "Mitochondrial DNA Insertions in Mammalian Nuclear Genomes Do Not Randomly Occur", 第34回日本分子生物学会2011年会, 横浜
  • 深沢 嘉紀, Wan Raymond, 傅 思縉, 辻 淳子, 崎山 則征, 今井 賢一郎, Horton Paul, "Computational analysis of mitochondrial cleaved proteins based on proteomic analyses",第34回日本分子生物学会2011年会, 横浜
  • 広川 貴次,: "In silico screening for protein-protein interaction inhibitors", 3rd Symposium on Systems and Synthetic Biology, 中国, 蘇州大学, 2011年12月10日
  • 露崎 弘毅, 富永 大介, 権娟大, 宮崎 智: "2way-AIC: マイクロアレイデータに基づく発現量変動遺伝子検出の新手法", 第86回MPS・第27回BIO合同研究発表会, 東京, 2011年12月1日
  • Martin Frith: "Reliable large-scale sequence comparison", ISCB-Asia, Kuala Lumpur, 30th Nov. 2011
  • 今井 賢一郎, 牧内 貴志, 富井 健太郎, 崎山 則征, 村上 佳��, 野崎 智義, Horton Paul,: "赤痢アメーバのミトコンドリア由来オルガネラにおける新規外膜タンパク質の探索", 第12回日本蛋白質科学会年会, 名古屋国際会議場, 2011年11月30日
  • Martin Frith: "Reliable large-scale sequence comparison, Multilevel Systems Biology: Genomes, Structures, and Networks", Suita Campus, Osaka University, 17th Nov. 2011
  • Paul Horton: "Recent advances in protein sorting signal prediction, Bioinformatics of Human & Animal Genomics, Suzhou, China, 15th Nov. 2011
  • Martin Frith: "Reliable giga-scale sequence comparison, Bioinformatics of Human and Animal Genomics, Suzhou, China, 15th Nov. 2011
  • 辻 淳子, Frith Martin, 富井 健太郎, Horton Paul, "Patterns of Mitochondrial DNA Insertion in Mammalian Nuclear Genomes", Cold Spring Harbor Asia Conference: Bioinformatics of Human and Animal Genomics, 中国, 蘇州, 2011年
  • 藤渕 航, 油谷 幸代, Junko Yamane, Satoshi Imanishi, Hiromi Akanuma, Hideko Sone, Seiichiroh Ohsako: "Prediction of Chemical Toxicity by Network-based SVM on ES-cell Validation System, CBI学会・JSBi 合同大会, 神戸国際会議場, 2011年11月9日
  • 本野 千恵, 小池 亮太郎, 清水 佳奈, 城田 松之, 雨宮 崇之, 富井 健太郎, 長野 希美, 佐藤 美和, 酒谷 尚史, 三十尾 潔高, 木寺 詔紀, 廣明 秀一, 白井 剛, 木下 賢吾, 野口 保, 太田 元規: "SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins, CBI/JSBi2011, 神戸, 2011年11月8日
  • 清水 佳奈, 荒井 ひろみ, 浜田 道昭, 津田 宏治, 広川 貴次, 佐久間 淳, 浅井 潔: "Privacy preserving search for chemical compound libraries, CBI/JSBi 2011, 神戸国際会議場, 2011年11月8日
  • Paul Horton: "Recent Advances in Protein Sorting Sequence Prediction, IEEE BIBE2011, Taichung, Taiwan, 24th Oct. 2011
  • Martin Frith: "Pair-wise sequence comparison: old and new solutions, HPCI Seminar, CBRC, 21st Oct. 2011
  • Horton Paul, "Perlによる配列データの単発的情報処理、fastaplとfastqplによる具体例を通して", HPCIセミナー東京・産総研臨界副都心センタ, 2011年10月14日
  • Martin Frith: "Reliable giga-scale sequence comparison, ComBio2011, Cairns, Australia, 28th Sep. 2011
  • 富永 大介: "Fitting an S-system model to time series datasets, Cell Functional Analysis in silico Workshop, 群馬県吾妻郡草津町, 2011年9月19日
  • 根本 航, 藤 博幸: "A method to select homologous sequences appropriate for functional region prediction by spatial statistics with structure information, 日本生物物理学会, 姫路, 2011年9月16日
  • 山崎 智, 中村 周吾, 福井 一彦: "二次構造情報とフラグメント構造群に基づくRNA三次構造予測, 第10回 新しいRNA/RNPを見つける会, 沖縄, 2011年9月15日
  • Paul Horton, 渡邊 真也, 久須田 樹哉, 施 建明: "多クラス分類のためのデータ分布に基づく階層化手法の提案, MPS研究会, 室蘭工業大学, 2011年9月15日
  • Pessiot Kenichi Jean-Francois, Wataru Fujibuchi: "A ranking-based alternative to the discriminant analysis framework, The Behaviormetric Society of Japan 2011, Okayama University of Science, 14th Sep. 2011
  • 広川 貴次: "In silico screening for protein-protein interaction inhibitors using structure-based features and chemical space analysis., 生合成マシナリー:生物活性物質構図尾多様性創出システムお解明と制御", 北海道大学理学部, 2011年9月5日
  • 光山 統泰: "An identification of secondary structure conserved elements in mammalian syntenic regions, IEEE International Conference on Systems Biology, 珠海, 中華人民共和国, 4th Sep. 2011
  • 深沢 嘉紀, Ross KK Leung, Stephen KW Tsui, Paul Horton: "Evolutionary sequence divergence predicts protein sub-cellular localization signals", The Fifth IEEE International Conference on Systems Biology, 珠海, 中華人民共和国, 3rd Sep. 2011
  • 藤 博幸: "Introduction to Protein Bioinformatics, 応用トポロジー研究集会, 福岡, 2011年8月30日
  • Hiroyuki Toh: "Co-evolutionary analysis of protein-protein interaction, ICR Symposium to celebrate the bioinformatcs center's 10 year anniversary and new restructuring , Uji, Kyoto, 29th Aug. 2011
  • Paul Horton: "Mitochondria", 京大バイオインフォマティクスセンター十周年シンポジウム, 京都大学, 化学研究所(宇治市), 2011年8月29日
  • Michihiro Tanaka: "Systematic genome-wide analysis of the highly triglyceride production system in Fistulifera sp. strain JPCC DA0580", Cell Functional Analysis in silico Workshop, Kusatsu, 19th Aug. 2011
  • Wataru Fujibuchi: "Stem cell informatics and beyond, Cell Functional Analysis in silico Workshop, Kusatsu, 19th Aug. 2011
  • 幡野 晶子, 千葉 啓和, 谷口 丈晃, 山根木 康嗣, 高井 貴子, 田中 博, 藤渕 航: "CELLPEDIA: a repository for human cell information for cell studies and differentiation analyses", Cell Functional Analysis in silico Workshop, Kusatsu, 19th Aug. 2011
  • Sachiyo Aburatani: "Network inference by structural equation modeling, Cell Functional Analysis in silico Workshop, Kusatsu, 19th Aug. 2011
  • 山崎 智: "RNA三次構造予測の現状と展望", 次世代バイオインフォマティクス研究会, 札幌, 3rd Aug. 2011
  • Kazutaka Katoh, Christian Ledergerber, Christophe Dessimoz, Manuel Gil: "Effect of adding homologs in multiple sequence alignment and phylogenetic analysis, SMBE2011, Kyoto, 27th Jul. 2011
  • Kana Shimizu, Koji Tsuda: "Fast and exact algorithm for Next Generation Sequencing data analysis, ISMB/ECCB 2011, Vienna, 18th Jul. 2011
  • Paul Horton: "Next-generation genome alignment with LAST, ISMB EECB 2011, Vienna, Austria, 18-Jul 2011
  • Terai G., Mituyama T., Asai K.: "Prediction of conserved miRNA precursors and their mature forms by integrating positionspecific structural features, The 16th Annual Meeting of The RNA Society and The RNA Society of Japan 13th Annual Meeting, Kyoto, 17th Jul. 2011
  • Kiryu H., Mituyama T., Asai K.: "Searching for Structural RNA Motifs by Using the Energy Model of Secondary Structures, The 16th Annual Meeting of The RNA Society and The RNA Society of Japan 13th Annual Meeting, Kyoto, 14th Jul. 2011
  • Martin Frith: "Giga-scale sequence comparison, The 9th International Workshop on Advanced Genomics, National Center of Sciences, Tokyo, 12th Jul. 2011
  • Paul Horton: "Sequence comparison: the once and future problem, Bio-IT APAC, Shenzhen , China, 6th Jul. 2011
  • 大安 裕美, 神谷 成俊, 藤 博幸: "プロスタグランジン受容体のリガンド認識機構と機能分化, 日本蛋白質科学会, 吹田, 2011年6月9日
  • 小田 浩之, 太田 元規, 藤 博幸: "Comparative studies of profi les to predict functionally constrained sites, 日本蛋白質科学会, 吹田, 2011年6月8日
  • 根本 航, 福井 一彦, 藤 博幸: "Gタンパク質共役型受容体オリゴマー機能解析を支援するバイオインフォマティクス手法開発, 日本蛋白質科学会年会, 吹田, 2011年6月8日
  • 佐藤 哲也, 藤 博幸: "ミラーツリー法の改良, 日本蛋白質科学会, 大阪, 2011年6月7日
  • 富永 大介: "Using Bayesian Network for the S-system Network Inference Method to Oscillating Time Series Data, The XII International Congress on Molecular Systems Biology, Lleida市, スペイン, 2011年5月12日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 浅井 潔: "Life Science Integrated DB Project: Development of Active Wokflow with KNIME", Bio-IT World Conference & Expo , Boston, 2011年4月12日
  • Kana Shimizu: "Genome-wide analyses of intrinsic disorder in protein-protein interaction", BIT Life Sciences'4th Annual PepCon 2011, Beijing, 23th Mar. 2011
  • Pessiot Jean-Francois, 金 サ尢驪 藤渕 航: "Learning similarity functions for multi-platform gene expression data, SIG-BIO, Kyoto University, 2011年3月11日
  • 藤渕 航: "応用システムバイオロジー研究会の開会の辞, JSBi応用システムバイオロジー研究会, 東京医科歯科大学, 2011年2月28日
  • Martin Frith: "Clustering CAGE tags by density, FANTOM5 Ume Blossom meeting, Yokohama, 21st Feb. 2011
  • 藤渕 航: "細胞インフォマティクス解析手法の紹介", 第2回早稲田大学・感染研の連携セミナー, 早稲田大学先端生命医科学センター, 2011年1月20日
  • 斉藤 裕, 佐藤 健吾, 榊原 康文: "Fast and accurate clustering of noncoding RNAs using ensembles of sequence alignments and secondary structures, The Ninth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2011), Incheon, Korea, 2011年1月14日
  • Katou, T., Nagano, N.: "Discriminative Structural Approaches for Enzyme Active-Site Prediction", The Ninth Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC 2011), 任川, 韓国,13rd Jan. 2011.
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