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- 論文(ポスター発表:2002年)
論 文(ポスター発表:2002年)
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Yabuki, Y., Mukai, Y., Suwa, M.: "GENIUS II: A database system including complete genome ORFs that are assigned to protein three-dimensional domains", GIW 2002 (The 13th International Conference on Genome Informatics), Tokyo, 17th Dec., 2002.
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Aita, T.: "Formulation of the energy distribution among a globular protein structure ensemble for the high-through-put screening of sequences", GIW 2002 (The 13th International Conference on Genome Informatics), Tokyo, 17th Dec., 2002.
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Gotoh, O.: "Improvement in performance of homology-based prediction of human gene organizations", GIW 2002 (The 13th International Conference on Genome Informatics), Tokyo, 17th Dec., 2002.
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Suwa, M.: "SEVENS: A Comprehensive collection of Human Swven Transmembrane Helix Receptors", GIW 2002 (The 13th International Conference on Genome Informatics), Tokyo, 16th Dec., 2002.
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長崎 英樹, 後藤 修, 諏訪 牧子: "ヒト遺伝子の選択的スプライス部位の解析", 第25回分子生物学会, 横浜, 2002年12月13日.
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上村 尚美, 向井 有理, 石橋 佳朋, 麻生 定光, 太田 成男, 宗像 可枝, 後藤 雄一: "核遺伝子産物MIDASによるミトコンドリアの増殖と分布形態の変化", 第25回分子生物学会, 横浜, 2002年12月11日.
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富永 大介: "並列計算環境を用いた細胞内生体反応ネットワークの構造推定", ゲノムひろば, 福岡市, 2002年11月17日.
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Suwa, M.: "Sevens: Overview of Comprehensive Collection of Human 7 transmembrane helix receptors", AIST international symposium 2002 -Bioinformatics in the Post-Genome Era-, Tokyo, 8th Nov., 2002.
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Tomii, K., Ota, M., Noguchi, T., Akiyama, Y.: "Constructing a protein structure prediction server PILOT", AIST international symposium 2002 -Bioinformatics in the Post-Genome Era-, Tokyo, 8th Nov., 2002.
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Noguchi, T., Akiyama, Y.: "PDB-REPRDB: a database of representative protein chains from the Protein Data Bank (PDB)", AIST international symposium 2002 -Bioinformatics in the Post-Genome Era-, Tokyo, 8th Nov., 2002.
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Fukuda, K.I.: "SPARK DB : Signal Transduction Pathways with decomposable processes", AIST international symposium 2002 -Bioinformatics in the Post-Genome Era-, Tokyo, 8th Nov., 2002.
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Sagara, J., Nakamura, S., Kenmochi, N., Asai, K.: "Prediction of snoRNA In Human Genome", AIST international symposium 2002 -Bioinformatics in the Post-Genome Era-, Tokyo, 8th Nov., 2002.
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Nishimura, S.I., Takahashi, K.: "Swithcing Escape Behavior of Bacteria against Their Enemies", AIST international symposium 2002 -Bioinformatics in the Post-Genome Era-, Tokyo, 8th Nov., 2002.
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Mizuno, M., Suwa, M.: "Identification and Characterization of Splice Sites in Human Genes by GenBank Annotation and EST Mapping", AIST international symposium 2002 -Bioinformatics in the Post-Genome Era-, Tokyo, 8th Nov., 2002.
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竪田 明子, 広川 貴次, 加治屋 健太郎, 諏訪 牧子, 片岡 宏志, 東原 和成: "嗅覚受容体の匂い分子結合部位の構造解析", 第75回日本生化学学会, 京都, 2002年10月14日.
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上村 尚美, 向井 有理, 石橋 佳朋, 麻生 定光, 太田 成男, 宗像 可枝, 後藤 雄一: "核遺伝子産物 MIDAS によるミトコンドリア増殖機構", 第75回日本生化学学会, 京都, 2002年10月14日.
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水野 政彦, 諏訪 牧子: "ヒト遺伝子領域予測およびスプライス部位解析のためのデータセット構築", 産総研 生命情報科学人材養成コース 設立1周年記念シンポジウム「21世紀生命情報科学の飛翔ーお台場から世界に向けてー」, 東京, 2002年10月4日.
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富井 健太郎, 太田 元規, 野口 保, 秋山 泰: "タンパク質立体構造予測サーバーPILOTの構築", 産総研 生命情報科学人材養成コース 設立1周年記念シンポジウム「21世紀生命情報科学の飛翔ーお台場から世界に向けてー」, 東京, 2002年10月4日.
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富永 大介: "遺伝子ネットワークのモデリングのための多次元非線形実数最適化手法の開発", 産総研 生命情報科学人材養成コース 設立1周年記念シンポジウム「21世紀生命情報科学の飛翔ーお台場から世界に向けてー」, 東京, 2002年10月4日.
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野口 保: "PDB代表タンパク質チェイン決定システム(PDB-REPRDB)", 産総研 生命情報科学人材養成コース 設立1周年記念シンポジウム「21世紀生命情報科学の飛翔ーお台場から世界に向けてー」, 東京, 2002年10月4日.
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西村 信一郎: "Chasing and Escaping: Fighting between Phagocytes and Bacteira", 産総研 生命情報科学人材養成コース設立1周年記念シンポジウム「21世紀生命情報科学の飛翔ーお台場から世界に向けてー」, 東京, 2002年10月4日.
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旭井 亮一: "SPRによるトランススクリプトームを用いた化学物質の検出法", 産総研 生命情報科学人材養成コース 設立1周年記念シンポジウム「21世紀生命情報科学の飛翔ーお台場から世界に向けてー」, 東京, 2002年10月4日.
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長野 希美: "配列・立体構造・機能に基づくスーパーファミリー、フォールド・レベルの系統的解析−TIMバレル型酵素蛋白質ファミリーへの応用", 産総研生命情報科学人材養成コース 設立1周年記念シンポジウム「21世紀生命情報科学の飛翔ーお台場から世界に向けてー」, 東京, 2002年10月4日.
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Nishimura, S.I.: "Chasing and Escaping: Fighting between Phagocytes and Bacteira", International Conference on Morphogenesis and Pattern Formation in Biological systems - Experiments and Models, Nagoya, 24th Sept. 2002.
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Fukui, K., Akiyama, Y., Takahashi, K.: "Experimental and computational study of fragmentation in peptides with CID and IRMPD", CBI学会第3回大会(2002年大会), 東京, 2002年9月18日.
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Fukui, K., Akiyama, Y., Takahashi, K.: "Fragmentation studies for peptides using FTICR mass spectrometry and MS/MS: Experiment and simulation", 224th American Chemical Society (ACS) National Meeting, Boston, MA, USA, 21st Aug., 2002.
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Nagano, N., Thornton, J.: "The evolutionary relationships between TIM barrel glycosidase superfamily based on the sequences, structures and functions", 16th symposium of the protein society, San Diego, CA, USA, 17th Aug., 2002.
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Hirokawa, T., Suwa, M., Akiyama, Y.: "Analysis of a reentrant loop in membrane proteins for classification and prediction", 16th symposium of the protein society, San Diego, California, USA, 17th Aug., 2002.
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Sagara, J., Nakamura, S., Kenmochi, N., Sato, T., Okouchi, I., Suwa, M., Asai, K.: "Prediction of snoRNAs in the Human Genome", ISMB, Edmonton, Canada, 3rd Aug., 2002.
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Kikuchi, S., Tominaga, D., Arita, M., Takahashi, K., Tomita, M.: "On dynamics estimation from given time-course data using GA and S-system: PEACE1", ISMB, Edmonton, Canada, 3rd Aug., 2002.
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相良 純一, 浅井 潔, 諏訪 牧子, 佐藤 智之, 大河内 郁雄, 中村 周吾, 剣持 直哉: "モチーフ探査手法を用いた snoRNA 部位の予測", 第4回日本RNA学会, つくば, 2002年7月16日.
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Sasaki, T., Sonoyama, M., Mukai, Y., Nakazawa, C., Mitaku, S.: "Structural stability of bacteriorhodopsin solubilized by Triton X-100", 1st Asian Conference on Photobiology, Awaji Island, Japan, 22th June, 2002.
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山田 真介, 富井 健太郎, 太田 元規, 秋山 泰, 山名 早人: "構造プロファイルを用いた局所構造予測法の開発", 第2回日本蛋白質科学会年会, 名古屋国際会議場, 2002年6月14日.
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太田 元規, 富井 健太郎, 野口 保, 津田 宏治, 浅井 潔, 秋山 泰: "配列プロフィールサーチ,構造-配列適合性関数と非線形判別法を利用したタンパク質の構造認識法", 第2回日本蛋白質科学会年会, 名古屋国際会議場, 2002年6月14日.
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広川 貴次, 諏訪 牧子, 秋山 泰: "膜タンパク質における再挿入型ループ構造の分類と予測", 第2回日本蛋白質科学会年会, 名古屋国際会議場, 2002年6月14日.
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Fukui, K., Akiyama, Y., Takahashi, K.: "ESI-FTICR MS with Infrared Multiphoton Dissociation : Analysis of Fragmentation of Peptides", 50th Annual Conference American Society for Mass Spectrometry (ASMS), Orland, Florida, USA, 3rd June, 2002.
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相良 純一, 浅井 潔, 諏訪 牧子, 佐藤 智之, 大河内 郁雄, 中村 周吾, 剣持 直哉: "モチーフ探査手法を用いた snoRNA 部位の予測", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月8日.
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野口 保, 富井 健太郎, 高橋 明子, 秋山 泰, 太田 元規: "FOREST(タンパク質立体構造認識手法ベンチマーク用標準プラットフォーム)", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月8日.
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後藤 修: "ホモロジーを用いた真核生物ゲノム配列からの遺伝子発見", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月8日.
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富永 大介: "遺伝子間相互作用の同定のための多次元非線形最適化手法の開発", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月8日.
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高橋 勝利, 富永 大介, 原 正樹: "2次元電気泳動像自動解析システムの開発", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月8日.
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富井 健太郎, 秋山 泰: "距離拘束条件付threadingによるタンパク質の構造認識", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月8日.
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富永 大介: "遺伝子ネットワークの解明のための数理モデル最適化", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月7日.
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向井 有理, 長崎 英樹, 諏訪 牧子: "原核生物と真核生物オルガネラタンパク質の相関性", 平成13年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会 合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2002年2月7日.
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佐々木 貴規, 向井 有理, 園山 正史, 中澤 千映子, 美宅 成樹: "TritonX-100により可溶化されたバクテリオロドプシンの構造安定性", 文部科学省科学研究費特定領域研究(C) 「ゲノム情報科学」『ゲノム情報科学の新展開』公開シンポジウム, 東京, 2002年1月12日.
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Takahashi, K., Hara, M., Tominaga, D.: "PiKA2: Automated analysis and magagement system for protein 2D-PAGE images", Pacific Symposium on Biocomputing 2002, Kauai, Hawaii, USA, 5th Jan., 2002.
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Fukuda, K.I.: "SPARK : a Signal PAssing NetwoRK database of Homo sapiens", Pacific Symposium on Biocomputing 2002, Kauai, Hawaii, USA, 5th Jan., 2002.
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Tominaga, D.: "Inference Algorithm for Gene Gerulatory Network from Time-course Data Based on Real Value Genetic Algorithm", Pacific Symposium on Biocomputing 2002, Kauai, Hawaii, USA, 5th Jan., 2002.
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