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  • 論文（ポスター発表：2010年）

論　文（ポスター発表：2010年）

  • Horton, P., Fukasawa, Y., Wan, R., Fu, S-C., Tsuji, J., Sakiyama, N., Imai, K.: "Mitochondrial Protein Cleavage Site Predictor", IEEE Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Hongkong, 18th Dec. 2010
  • Shimizu, K., Tsuda, K.: "SLIDESORT: All pairs similarity search for short reads: ", 2010年日本バイオインフォマティクス学会年会, 福岡, 2010年12月15日
  • Ito, J., Tabei, Y.Shimizu, K., Tomii, K., Tsuda, K.: "Fast Alignment-Free Comparison of Known and Unknown Protein Ligand Binding Sites", 2010年日本バイオインフォマティクス学会年会, 福岡, 2010年12月14日
  • Aburatani, S., Tominaga, D.: "Network Inference of Lineage-specific Regulation by PAL-1 in the C.elegans", BMB 2010, 福岡, 2010年12月13日
  • Tominaga, D.: "One Stop Detection System for Periodicity on Short Length Time Series Data", 2010年日本バイオインフォマティクス学会年会, 福岡, 2010年12月13日
  • 吉成泰彦, 光山 統泰: "二次構造保存ゲノムシンテニー領域由来非コードRNAの予測", 第33回日本分子生物学会年会, 神戸, 2010年12月10日
  • Tominaga, D., Aburatani, S.: "Periodicity detection method for short length time series data",第33回日本分子生物学会年会, 神戸, 2010年12月9日
  • 小田浩之, 藤 博幸: "Application of 3D-profile to Comparative Studies of Profiles",第33回日本分子生物学会年会, 神戸, 2010年12月9日
  • 崎山 則征, 今井 賢一郎, Horton Paul: "An analysis of synonymous codon usage bias versus the subcellular localization of proteins in Saccharomyces cerevisiae", 第33回日本分子生物学会年会, 神戸, 2010年12月9日
  • 今井 賢一郎, 藤田直也, Michael Gromiha, Horton Paul: "Eukaryote-wide Sequence Analysis of Mitochondrial beta-barrel Outer Membrane Proteins",第33回日本分子生物学会年会, 神戸, 2010年12月9日
  • 市原　寿子、藤　博幸: “ハブ分子としてのユビキチン様タンパク質の情報解析研究, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会, 神戸, 2010年12月8日
  • 大安　裕美、根本　航、姜　勇求、藤　博幸: “Ccomputational Analysis of Functional Differentiation of Chemokine Receptors, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会, 神戸, 2010年12月7日
  • 隈　啓一、岩部　直之、加藤　和貴、藤　博幸、佐々木　剛、廣瀬　希、管　裕、宮田　隆、鈴木　穣、笠原　雅弘、新井　理、大石　加寿子、鹿児島　浩、豊田　敦、黒木　陽子、菅野　純夫、森下　真一、小原　雄治、藤山　秋佐夫: “動物の多細胞化と遺伝子族多様化の関連性: II. . 細胞接着因子と転写因子, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会, 神戸, 2010年12月7日
  • 岩部　直之、隈　啓一、加藤　和貴、藤　博幸、佐々木　剛、廣瀬　希、管　裕、宮田　隆、鈴木　穣、笠原　雅弘、新井　理、大石　加寿子、鹿児島　浩、豊田　敦、黒木　陽子、菅野　純夫、森下　真一、小原　雄治、藤山　秋佐夫: “動物の多細胞化と遺伝子族多様化の関連性: I. シグナル伝達系, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会, 神戸, 2010年12月7日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 野口 保, 浅井 潔: "情報統合基盤技術を用いた配列・タンパク質ワークフロー解析", 産総研オープンラボ, つくば, 2010年10月15日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 野口 保, 浅井 潔: "ライフサイエンス統合DB：ワークフロー開発", ライフサイエンスの未来へ;10年先のデータベースを考える;, 東京, 2010年10月5日
  • Imai, K., Fujita, N., Horton, P.: "Development of High Performance Predictor of Bacterial and Mitochondrial Outer Membrane beta-barrel Proteins", 第48回生物物理学会年会, 仙台, 2010年9月22日
  • 崎山 則征, Horton Paul: "An analysis of synonymous codon bias for mitochondrial localizing mRNA in Saccharomyces cerevisiae", 第48回日本生物物理学会年会, 仙台, 2010年9月22日
  • Yamasaki, S., Nakamura, S., Fukui, K.: "Attempts to predict RNA tertiary structures using fragment structural library based on secondary structures", 第48回日本生物物理学会年会, 仙台, 2010年9月21日
  • 伊東 純一、Yasuo Tabei、清水 佳奈、富井 健太郎、津田 宏治: “An Exhaustive Search of Known and Unknown Protein-Ligand Binding Sites with A Fast Alignment-Free Method, 第48回日本生物物理学会年会, 仙台, 2010年9月21日
  • 諏訪　牧子、小野　幸輝、杉原　稔: “タンパク質内部の極性環境を基にしたGタンパク質共役型受容体（GPCR）の構造分類, 第48回生物物理学会年会, 仙台, 2010年9月20日
  • 幡野　晶子、千葉　啓和、MOESA Amri Harry、谷口　丈晃、永家　聖、藤渕　航: “CELLPEDIA: COMPREHENSIVE HUMAN CELL DATABASE TOWARD CELL DIFFERENTIATION ANALYSIS, CBI学会2010年大会, 東京, 2010年9月16日
  • Fukasawa, Y., Sakiyama, N., Imai, K., Fu, S-C., Wan, R., Tsuji, J., Horton, P.: "Informatics analysis of mitochondrial matrix targeting signal and cleavage sites based on large-scale proteomics datasets", The 3rd international symposium on Protein Community, Nara, Japan, 14th Sep. 2010
  • Imai, K., Fujita, N., Gromiha, M.M., Horton, P.: "Eukaryote-wide Sequence Analysis of Mitochondrial beta-barrel OuterMembrane Proteins", Protein Community, Nara, Japan, 14th Sep. 2010
  • Katou, T., Nagano, N.: "Metric-learning based active site prediction for enzyme proteins", CBRC2010/BiWO2010, 東京, 2010年7月29日
  • Sakiyama, N., Horton, P.: "An analysis of synonymous codon usage bias versus the subcellular location of proteins in Saccharomyces cerevisiae", CBRC2010, 東京, 2010年7月29日
  • Chiba, H., Tanaka, T., Miyake, M., Fujibuchi, W.: "PREDICTION OF NOVEL EFFEICIENT INDUERS FOR MESENCHYMAL STEM CELL DIFFERENTIATION", CBRC2010, 東京, 2010年7月29日
  • 本野　千恵、清水　佳奈、富井　健太郎、長野　希美、野口　保、廣明　秀一、雨宮　崇之、城田松之、小池亮太郎、白井剛、木下賢吾、太田元規: “CONSTRUCTION OF SAHG (STRUCTURAL ATLAS OF HUMAN GENOME) DATABASE, CBRC2010, 東京, 2010年7月29日
  • 富井　健太郎、福地　佐斗志、西川　建: “STRUCTURE PREDICTION TARGETING CRYPTIC DOMAINS OF HUMAN PROTEINS, CBRC2010, 東京, 2010年7月29日
  • 伊東 純一、Yasuo Tabei、清水 佳奈、富井 健太郎、津田 宏治: “AN EXHAUSTIVE SEARCH OF KNOWN AND UNKNOWN PROTEIN-LIGAND BINDING SITES WITH A FAST ALIGNMENT-FREE METHOD, CBRC2010, 東京, 2010年7月29日
  • 幡野　晶子、千葉　啓和、MOESA Amri Harry、谷口　丈晃、永家　聖、藤渕　航: “CELLPEDIA: COMPREHENSIVE HUMAN CELL DATABASE TOWARD CELL DIFFERENTIATION ANALYSIS, CBRC2010, 東京, 2010年7月29日
  • 市原 寿子、藤 博幸: “COMPUTATIONAL ANALYSIS OF UBIQUITIN-LIKE PROTEINS AS HUBS”, CBRC2010, 東京, 2010年7月29日
  • Nemoto, K., Okamura, Y., Terahara, T., Chiba, H., Fujibuchi, W., Takeyama, H.: "DIVERSITY ANALYSIS OF L-ARABINOSE METABOLIC ENZYME GENES IN SOIL METAGENOME TOWARDS BIOETHANOL PRODUCTION.", CBRC2010, 東京, 2010年7月28日
  • Sugihara, M., Fujibuchi, W., Suwa, M.: "Molecular Dynamics Study of Bovine Opsin and its Interaction with G-Protein", CBRC2010, 東京, 2010年7月28日
  • Noguchi, T., Yokota, K., Goshima, N., Kawamura, Y., Hirose, S.: "ESPRESSO: A SEQUENCE-BASED PREDICTOR FOR ESTIMATING PROTEIN EXPRESSION AND SOLUBILITY", CBRC2010, 東京, 2010年7月28日
  • 清水 佳奈, 津田 宏治: "ALL PAIRS SIMILARITY SEARCH IN EDIT DISTANCE", CBRC2010, 東京, 2010年7月28日
  • 木村 将之、池北雅彦、福井 一彦: “DOCKING STUDIES OF PROTEIN-CARBOHYDRATES INTERACTION”, CBRC2010, 東京, 2010年7月28日
  • 牛山 祥吾、福井 一彦: “DISTRIBUTED FILE SYSTEM FOR BIOINFORMATICS ANALYSIS”, CBRC2010, 東京, 2010年7月28日
  • Shimizu, K., Tsuda, K.: "Developing an exact method to find similar pairs with small edit-distance", The 18th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology , Boston, USA, 12nd Jul. 2010
  • Gromiha, M.M., Yokota, K., Selvaraj, S.Fukui, K.: "Comparative analysis of binding site residues and recognition mechanisms of protein-protein and protein-RNA complexes using energy based approach", ISMB 2010, Boston, USA, 12nd Jul. 2010
  • 本野　千恵、中田　淳一、富井　健太郎、清水　佳奈、長野　希美、野口　保、廣明　秀一、雨宮崇之、城田　松之、小池　亮太郎、白井　剛、木下　賢吾、太田　元規: “SAHG: Structural Atlas of Human Genome”, ISMB 2010, Boston, USA, 11th Jul. 2010
  • Yamasaki, S., Kono, H., Shimizu, K., Sarai, A., Terada, T.: "Information entropy as a measure of the contribution of indirect readout in protein-DNA recognitio", 第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年6月18日
  • 本野 千恵、中田 淳一、富井 健太郎、清水 佳奈、長野　希美、野口 保、廣明　秀一、雨宮　崇之、城田　松之、小池　亮太郎、白井　剛、木下　賢吾、太田　元規: “ヒトゲノム構造・機能アノテーションデータベースSAHG（Structural Atlas of Human Genome）の構築”, 第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年 6月18日
  • 廣瀬 修一、横田 恭宣、野口 保: “蛋白質発現系における可溶性蛋白質に見られる配列パターンの解析と可溶化予測”, 第10回蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年 6月18日
  • Gromiha, M.M., Yokota, K., Fukui, K.: "Energy based approach for comparative analysis of binding site residues in protein-protein and protein-RNA complexes ",第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年6月17日
  • Jun-ichi Ito、Yasuo Tabei、清水 佳奈、富井 健太郎、津田 宏治: "超高速近傍探索による蛋白質のリガンド結合部位、及び凹部の網羅的な比較", 第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年6月17日
  • 長野 希美, 酒谷 尚史: "酵素蛋白質の配列解析：ユビキタス酵素 vs 生物特異的酵素 Sequence analyses of enzyme proteins: Ubiquitous enzymes versus organism-specific enzymes", 第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年6月16日
  • Yuki Sakashita、Jun-ichi Ito、浅井 潔、富井 健太郎: "タンパク質の金属イオン結合部位予測精度向上のための新規要因の探索", 第10回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年6月16日
  • 合田 名都子, 清水 佳奈, 桑原 陽太, 天野 剛志, 池上 貴久、太田 元規、廣明 秀一: "PRESAT-vectorを用いた天然変性タンパク質配列の網羅的検証系の確立", 第１０回日本蛋白質科学会年会, 札幌, 2010年6月16日
  • 大安裕美、神谷成敏、藤 博幸: “プロスタノイド受容体群の機能分化に関する情報科学的解析”, 日本蛋白質科学会, 札幌, 2010年6月16日
  • 杉原 稔, 藤渕 航, 諏訪 牧子: "イカロドプシンとウシロドプシンの構造解析 -分子動力学法と配列解析によるアプローチ-", 第７回GPCR研究会, 東京, 2010年5月7日
  • Tominaga, D.: "Comparison of Detection Methods for Circadian Periodicity of Gene Expression Levels", BIT Life Sciences’ 2nd Annual World Vaccine Congress 2010, Beijing, China, 24th Mar. 2010
  • Aburatani, S.: "Network Inference of GAL regulatory system via Structure Equation Modeling in S.cerevisiae", System Biology of Microorganism, Institut Pasteur, 22nd Mar. 2010
  • Tominaga, D.: "Comparison of Fourier Based Methods for Detection of Periodic Gene Expression", Asian Young Researchers' Conference on Computational and Omics Biology, Tainan city, Taiwan, 10th Mar. 2010
  • 藤渕 航, 千葉 啓和: "大量遺伝子発現データと分化制御インフォマティクス", 平成21年度 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2010年2月4日
  • 清水 佳奈, 津田 宏治: "Clustering short reads by multi-sorting algorithm", 平成21年度 産総研・産技連 LS-BT合同研究発表会 , つくば, 2010年2月4日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 野口 保, 浅井 潔: "情報統合基盤技術によるアクティブ・ワークフロー解析", 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2010年2月4日
  • 富永 大介: "ネットワーク推定のための時系列データ解析システム", 定量生物学の会　第二回年会, 大阪, 2010年1月9日