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  • 論文（ポスター発表：2012年）

論　文（ポスター発表：2012年）

  • Poulsen Thomas, Frith Martin, Horton Paul,: "Utilizing probabilistic dependencies in low-complexity regions when detecting homologous regions of biological sequences.", ISCB-ASIA, Shenzhen, China, 2012年12月18日
  • 富永 大介: "Estimation of the Optimal Stage Division on Gene Expression Time Series", ISCB-Asia, SCCB 2012, 中国, 2012年12月17日
  • Shrestha Anish, Frith Martin,: "An Approximate Bayesian Approach to Mapping Paired-end DNA Reads", ISCB-Asia / AYRCOB 2012, Shenzhen, China, 2012年12月17日
  • 成原 寛太郎, 松山 泰男, 伊月 亜有子, 油谷 幸代,: "Statistical analysis of Enzyme Activity pathway for catabolizing malodor components in compost",日本分子生物学会年会, 福岡, 2012年12月14日
  • 富永 大介,: "An Mathematica Model for Phenotypic Scoring of siRNA effect", 日本分子生物学会年会, 福岡, 2012年12月14日
  • 丸山 翔平, 松山 泰男, 油谷 幸代,: "Automatic Estimation of Transcriptional Regulation by Machine Learning", 日本分子生物学会年会, 福岡, 2012年12月11日
  • 富永 大介,: "Measurement of 160;RNA Interference Effect for 160;siRNA Scoring", シンポジウム：細胞アッセイ技術の現状と将来, 東京, 2012年12月10日
  • 後藤 修, 森田 眞理子:"An automated approach toward collection of all Cytochrome P450 genes on published genomic sequences", チトクロムP450発見50周年記念シンポジウム, 九州大学, 2012年12月3日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 浅井 潔:"Development of a workflow system using integrated information platform technology", BiWO2012, 東京台場, 2012年11月1日
  • Poulsen Thomas, Frith Martin, Horton Paul,: "Utilizing information in low-complexity regions when detecting homologous regions of biological sequences.", BiWO2012, 2012年11月1日
  • 後藤 修, 森田 眞理子:"Gene-Structure-Aware Multiple Protein Sequence Alignment as a Tool for Assessment of Predicted Eukaryotic Gene Structures", 日本バイオインフォマティクス学会, 東京, 2012年10月15日
  • 富永 大介,: "A Predator-Pray model for RNAi dynamics", 生命医薬情報学連合大会, 東京都, 2012年10月14日
  • 曽 超, 後藤 修:"Mapping Middle-to-Long RNA-seq Reads onto Genomic　Sequence", 日本バイオインフォマティクス学会, 東京, 2012年10月15日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 浅井 潔:"解析プラットフォームによる統合利用環境の構築", トーゴーの日シンポジウム2012 〜ライフサイエンスデータベース統合の医学への応用を探る〜, 時事通信ホール, 2012年10月5日
  • 伊東 純一, Yasuo Tabei, 清水 佳奈, 津田 宏治, 富井 健太郎,: "PoSSuM: a database for searching similar pairs of known and potential ligand-binding sites in proteins",第50回日本生物物理学会年会, 名古屋, 2012年9月23日
  • 辻 淳子, 光山 統泰:"Pipeline for accurate estimation of cytosine methylation levels from bisulfite-conserved reads", IHEC 2012 Seoul Meeting, 韓国ソウル市, 2012年9月6日
  • 光山 統泰:"A graphical exon model for splice site sensitive RNA-seq mapping with integration of variable transcriptional evidences", IHEC 2012 Seoul Meeting, 韓国ソウル市, 2012年9月6日
  • 深沢 嘉紀, 傅 思縉, 辻 淳子, 崎山 則征, 今井 賢一郎, Horton Paul,: "MoiraiSP: a novel mitochondrial cleavage site predictor", Bioinformatics 2012, Stockholm, Sweden, 2012年7月13日
  • Osamu Gotoh, Mariko Morita:"The examination of enhanced diversity in the substrate recognition sites of P450", 11th international symposium on cytochrome P450 biodiversity & Biotechnology, Turin, 23-Jun. 2012
  • Osamu Gotoh, Mariko Morita:"Comparison of two strategies for comprehensive identification of P450 genes on multiple eukaryotic genomes", Turin, 23-Jun. 2012
  • 塩田 拓也, 崎山 則行, 神谷　恵, 島本 真由子, 今井 賢一郎, 浅野 悠史, 富井 健太郎, Horton Paul, 遠藤 斗志也,: "in vivo部位特異的光架橋法を用いたミトコンドリア外膜膜透過装置TOM40複合体の相互作用解析", 第12回日本蛋白質科学会年会, 名古屋, 2012年6月22日
  • 今井 賢一郎, 富井 健太郎, 崎山 則行, 牧内 貴志, 村上 佳隆, 野崎 智義, Horton Paul,: "赤痢アメーバのミトコンドリア由来オルガネラにおける新規外膜タンパク質の探索", 第12回日本蛋白質科学会年会, 名古屋, 2012年6月20日
  • 藤 博幸, 大安裕美, 根本航:"ケモカイン受容体の機能部位の情報解析", 日本蛋白質科学会, 名古屋, 2012年6月20日
  • Ito J, Tabei Y, Shimizu K, Tsuda K, and Tomii K:"PoSSuM: a database of known and potential ligand-binding sites in proteins", Bioinformatics 2012, Stockholm, 11-Jun. 2012
  • K. Fukui, T. Tashiro, Y. Yabuki, K. Asai:"A Composition of Bioinformatics Workflows using Platform and Semantic Technologies", Bio-IT World Conference & Expo 2012, Boston, 24-Apr. 2012
  • Sachiyo Aburatani, Wataru Fujibuchi:"Inference of transcriptional regulatory network in embryogenesis", Systems Biology: Global Regulation of Gene Expression meeting, Cold Spring Harbor, 20-Mar. 2012
  • Daisuke Tominaga:"An algorithm for the optimal differentiation of stages of gene expression time series", Systems Biology: Global Regulation of Gene Expression meeting, Cold Spring Harbor, 20-Mar. 2012
  • 今井 賢一郎, 藤田 直也, Michael Gromiha, Paul Horton:"シロイヌナズナ・プロテオームにおける新規ミトコンドリア・葉緑体β型外膜タンパク質の探索", 第53回日本植物生理学会年会, 京都産業大学, 2012年3月16日
  • Paul Horton:"fastapl,fastqpl、FAST{AQ}配列データ処理ツール", 平成23年度 第11回 産総研・産技連 LS-BT合同研究発表会, 産総研、つくば, 2012年1月31日
  • 油谷 幸代, 藤渕 航: "ショウジョウバエ初期胚におけるAPパターン形成ネットワークの推定", 平成23年度 第11回 産総研・産技連 LS-BT合同研究発表会, 産総研つくばセンター共用講堂, 2012年1月31日
  • 伊東 純一, 田部井 靖生, 清水 佳奈, 津田 宏治, 富井 健太郎: "タンパク質の既知及び未知基質結合部位データベースPoSSuM", 平成23年度第11回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば中央, 2012年1月31日
  • 本野 千恵, 中田 淳一, 清水 佳奈, 富井 健太郎, 長野 希美, 野口 保, 廣明 秀一, 城田 松之, 雨宮 崇之, 小池 亮太郎, 白井 剛, 木下 賢吾, 太田 元規: "Development of structure prediction pipeline for eukaryotic proteins and its application to proteins encoded in the human genome", 第11回 産総研・産技連 LS-BT合同研究発表会, つくば, 2012年1月31日
  • 今井 賢一郎, 富井 健太郎, 崎山 則征, 牧内 貴志, 村上 佳隆, 野崎 智義, Paul Horton: "赤痢アメーバにおけるミトコンドリア由来オルガネラの新規β型外膜タンパク質の探索", 平成23年度 第11回 産総研・産技連 LS-BT合同研究発表会, 産総研つくばセンター共用講堂, 2012年1月31日
  • 富永 大介: "細胞の状態遷移検出のための小サンプル時系列データの最適モデリング", ライフサイエンス分野融合会議・ライフサイエンス部会・バイオテクノロジー分科会 合同研究発表会, つくば市, 2012年1月31日
  • 末永 敦, 沖本 憲明, 平野 秀典, 福井 一彦: "タンパク質ーリガンド結合親和性計算手法の開発", 第１１回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2012年1月31日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 浅井 潔: "情報統合基盤技術を用いた解析ワークフロー開発", 第11回 産総研・産技連 LS-BT合同研究発表会, つくば, 2012年1月31日
  • Paul Horton:"fastapl and fastqpl, flexible tools for processing FASTA and FASTQ format data", BiWO2011, Tokyo Daiba, 26-Jan. 2012
  • 加藤 毅, 長野 希美: "Metric-learning based active site prediction for enzyme proteins", BiWO2011, 東京台場, 26th Jan. 2012
  • Martin Frith: "A MOSTLY-TRADITIONAL APPROACH IMPROVES ALIGNMENT OF BISULFITE-CONVERTED DNA", CBRC2011, Tokyo, 26th Jan. 2012
  • 伊藤 真和吏, 伊東 純一, 久保山 哲二, 富井 健太郎: "EVALUATING THE PERFORMANCE OF GLYCAN CLASSIFICATION BY USING NOVEL SCORING MATRICES FOR MONOSACCHARIDES", CBRC2011, 臨海副都心センター, 25th Jan. 2012
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 浅井 潔: "LIFE SCIENCE INTEGRATED DB: DEVELOPMENT OF ACTIVE WORKFLOW", CBRC2011, 臨海副都心センター, 25th Jan. 2012
  • Noriyuki Sakiyama, Kenichiro Imai, Martin Frith, Toutai Mituyama, Kentaro Tomii, Paul Horton:"What is determinant of mitochondrial localizing mRNA?", BiWO2011, Tokyo Daiba, 25-Jan. 2012
  • Junko Tsuji, Martin Frith, Kentaro Tomii, Paul Horton:"Computational Pipeline For Exhuming Inserted Organelle DNA fragments From the Nuclear Genome", BiWO2011, Tokyo Daiba, 25-Jan. 2012
  • Junko Tsuji, Frith Martin, Andreas Biegert, Johannes Soeding, Horton Paul:"CS-LAST: Aligning protein-coding sequences more accurately", BiWO2011, Tokyo Daiba, 25-Jan. 2012
  • 富永 大介: "An exhaustive combinatorial search for optimal division of gene expression time series", BiWO 2011, Tokyo, 24th Jan. 2012
  • 伊東 純一, 田部井 靖生, 清水 佳奈, 津田 宏治, 富井 健太郎: "PoSSuM: DATABASE TO FIND SIMILAR LIGAND BINDING POCKETS OF PROTEINS", CBRC2011, 臨海副都心センター, 5th Jan. 2012