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  • 論文（ポスター発表：2008年）

論　文（ポスター発表：2008年）

  • 長尾 知生子, 長野 希美, 水口賢司; "Analysis of the active sites of enzymes in CATH homologous superfamilies", 2008 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics, 千里, ライフサイエンスセンター, 大阪, 2008年12月16日.
  • 廣瀬 修一, 横田 恭宣, 五島 直樹, 河村 義史, 夏目 徹, 黒田裕, 野口 保; "タンパク質の可溶性データの解析と予測", 第46回生物物理学会年会, 神戸, 2008年12月5日.
  • Hirose, S., Shimizu, K., Inoue, N., Kanai, S. and Noguchi, T.; "Disordered region prediction by integrating POODLE series", Eighth Community Wide Experiment on the Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, island of Sardinia, Italy, 4th Dec. 2008.
  • 池田　和由, 肥後 順一, 富井 健太郎; "26残基長のタンパク質セグメントの構造変量の同定と構造クラス判別への応用", 第46回日本生物物理学会年会, 福岡市, 2008年12月4日.
  • 園部 裕樹, 伊東 純一, 池田 和由, 富井 健太郎, 山岸 明彦, 肥後 順一; "タンパク質から切り出されてきた多様な50残基長セグメントに見られる構造相関ネットワークの特徴", 第46回日本生物物理学会年会, 福岡, 2008年12月4日.
  • 今井 賢一郎, Michael Gromiha, Horton Paul; "Searching for new mitochondrial beta-barrel outer membrane proteins by refinement of the beta-signal", 第46回日本生物物理学会年会, 福岡, 2008年12月4日.
  • 本野 千恵, 広川 貴次; "タンパク質立体構造予測モデルの評価関数の検討 (Validation of statistical functions for evaluating protein structural models)", 第46回日本生物物理学会年会, 福岡, 2008年12月4日.
  • 長尾知生子, 長野 希美, 水口賢司; "酵素の詳細な機能予測に向けた、酵素の反応メカニズムと基質特異性を決定する配列、構造の解析", 第46回日本生物物理学会年会, 福岡国際会議場, 2008年12月4日.
  • Hirose, S., Ebina, T.; "Domain prediction using protein structure prediction and improved DLP-SVM", Eighth Community Wide Experiment on the Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, island of Sardinia, Italy, 4th Dec. 2008.
  • 亀田 倫史; "結晶化によるartifactを簡単に見積もる方法", 第46回日本生物物理学会年会, 福岡, 2008年12月3日.
  • Horton Paul; "Sequence Analysis of Mitochondrial β-Barrel Outer Membrane Proteins", GIW2008, Brisbane, Australia, 2nd Dec. 2008.
  • 亀田 倫史; "蛋白質計算における水分子モデルの影響", 分子シミュレーション討論会, 岡山, 2008年11月27日.
  • Michael Gromiha, Yokota, K., Tsukamoto, K., Fukui, K.; "Understanding the recognition mechanism of protein-protein complexes: energy based approach", Annual meeting of CBRC2008, Tokyo, 7th Nov. 2008.
  • 長野 希美; "電子伝達蛋白質の立体構造・配列に基づく系統的な解析・分類", 2008年度生命情報工学研究センター研究報告シンポジウム, 産総研臨海副都心センター, 2008年11月7日.
  • 藤渕 航, 岡田 吉史, ポール・ホートン; "CellMontage/SAMURAI: Gene Expression Similarity Search Tools", Annual meeting of CBRC2008, Tokyo, 6th Nov. 2008.
  • Wijaya Edward; "Modeling The Marginal Distribution of Gene Expression with Mixture Models", Annual meeting of CBRC2008, Tokyo, 6th Nov. 2008.
  • 今井 賢一郎, Michael Gromiha, Horton Paul; "βシグナルを用いた新規ミトコンドリアβバレル型外膜タンパク質の探索", Annual meeting of CBRC2008, Tokyo, 2008年11月6日.
  • Shimizu, K.; "Analysis of intrinsic protein disorder in a human protein-protein interaction network", Annual meeting of CBRC2008, Tokyo, 6th Nov. 2008.
  • Shimizu, K.; "Analysis of intrinsic protein disorder in a human protein-protein interaction network", The 1st Japan-India Bilateral Symposium on Bioinformatics, Tokyo, 6th Nov. 2008.
  • 廣瀬 修一, 横田 恭宣, 輪湖 博, 野口 保; "Prediction of protein structural flexibility from an amino acid sequence", CBRC2008, お台場, 2008年11月6日.
  • Hirose, S.; "Prediction of protein structural flexibility from an amino acid sequence", The 1st japan-india bilateral symposium on bioinformatics, Tokyo, 6th Nov. 2008.
  • 大里 直樹, Martin Frith; "脊椎動物ゲノムのタンパク質非コード領域からのDNAモチーフ配列の探索", Annual meeting of CBRC2008, Tokyo, 7th Nov. 2008.
  • Michael Gromiha, S-A. Chen, Y-Y. Ou; "Discrimination of beta-barrel Membrane Proteins and theirs Membrane Spanning Segments by using RBF Networks", The 2nd Taiwan-Japan Young researchers conference on computational and systems biology, Tokyo, 4th Nov. 2008.
  • 大里 直樹, Frith Martin; "Overrepresented Motifs in Highly Conserved Non-protein-coding Regions of Vertebrate Genomes", The 2nd Taiwan-Japan Young Researchers Conference on Computational and Systems Biology, Tokyo, 4th Nov. 2008.
  • 佐藤 健吾, 浜田 道昭, 光山 統泰, 浅井 潔, 榊原 康文; "A non-parametric Bayesian approach for predicting RNA secondary structures, 第11回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2008), 仙台, 2008年10月29日.
  • Tsukamoto, K., Yoshikawa, T., Hourai, Y., Fukui, K., Akiyama, Y.; "Affinity Evaluation and Prediction for Protein-Protein Docking", CBI Annual Meeting 2008 International Symposium, Tokyo, 22nd Oct. 2008.
  • Kenichiro Imai; "Comprehensive search for new mitochondrial beta barrel outer membrane proteins", CBI Annual Meeting 2008 International Symposium, Tokyo, 22nd Oct. 2008.
  • 大里 直樹, Martin Frith; "Overrepresented Motifs in Highly Conserved Non-protein-coding Regions of Vertebrate Genomes", The 16th CDB meeting on cis-sequence regulation and its evolution, 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター, 2008年9月29日.
  • Nemoto, W., Toh, H.; "A novel index to select appropriate sequences for multiple sequence alignment to predict functional regions of a protein", European Conference on Computational Biology, Cagliari, Italy, 23rd Sep. 2008.
  • Chiba, H., Nakagawa, S., Taniguchi, T., Fujibuchi, W.: "Designing Pyro-primer Sequences for Exhaustive Quantitation of mRNAs", 3rd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis, Zurich, Switzerland, 2008年9月11日.
  • Osato, N., Frith MC.: "Overrepresented DNA motifs in highly conserved non-protein-coding regions of vertebrate genomes", The eighth Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust conference on Genome Informatics, Wellcome Trust Conference Centre, 11th Sep. 2008.
  • 大里 直樹, Frith Martin: "脊椎動物ゲノムのタンパク質非コード領域からのDNAモチーフ配列の探索", 日本進化学会年会, 東京大学, 2008年8月22日.
  • 光山 統泰, 山田 浩一郎, 服部 恵美, 沖田 弘明, 小野 幸輝, 寺井 悟朗, 吉澤 亜耶, 浅井 潔; "新規RNA遺伝子発見を支援する機能性RNAデータベース", 第10回日本RNA学会年会・RNA2008, 札幌コンベンションセンター, 2008年7月23日.
  • Nemoto, W., Toh, H.; "A novel statistical method to predict functional regions of a protein", 16th Annual International Conference Intelligent Systems for Molecular Biology, Toronto, Canada, 21st Jul. 2008.
  • Sato, K., Hamada, M., Mituyama, T., Asaki, K., Sakakibara, Y.; "A non-parametric Bayesian approach for predicting RNA secondary structures", The 16th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2008), Tronto, Canada, 21th Jul. 2008.
  • Tomii, K.: "Correlation between amino acid preferences and patterns of residue packing in globular proteins", Protein Society, San Diego, USA, 21th Jul. 2008.
  • 千葉 啓和, 中川 草, 谷口 丈晃, 藤渕 航: "網羅的mRNA絶対定量のためのパイロプライマーの開発", 特定領域研究ライフサーベイヤ, 大阪大学医学部, 2008年6月28日.
  • Michael Gromiha:"Function based discrimination of membrane proteins using machine learning algorithms", 8th Annual meeting of the protein science society of Japan, Tokyo, 10th Jun. 2008.
  • 長野 希美; "電子伝達蛋白質の系統的解析・分類", 第8回日本蛋白質科学会, 東京・船堀, 2008年6月10日.
  • 廣瀬 修一, 横田 恭宣, 輪湖 博, 黒田裕, 金井 理, 野口 保; "アミノ酸配列情報を用いた蛋白質運動性の予測", 第八回日本蛋白質科学会年会, 東京, 2008年6月10日.
  • Suzuki, H., Yamagaki, T., Tachibana, T., Fukui, K.: "Fragmentation mechanism of negatively-charged Lewis-Type Trisaccharides in the Gas Phase: Experimental and Theoretical Studies", 56th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Denver, Colorado, USA, 1st Jun. 2008.
  • 諏訪 牧子; "ゲノム解析から探るGタンパク質共役型受容体（GPCR）ファミリーの多様性", GPCR研究会, 東京：科学未来館, 2008年5月9日.
  • 関嶋 政和, 本田 真也, 徳永 慎一, 村岡 洋一, 野口 保: "大規模分子動力学法による熱揺らぎ解析", スーパーコンピュータワークショップ 「大規模計算と分子のダイナミクス」, 岡崎, 愛知県, 2008年2月18日.
  • Suzuki, H., Yamagaki, T., Tachibana, T., Fukui, K.; "Fragmentation of Lewis-Type Trisaccharides in the Gas Phase: Experimental and Theoretical Studies", 16th International Symposium of SNU-UT-NTU Chemistry Departments, Seoul, Korea, 1st Feb. 2008.
  • 2/1 中川 草, 谷口 丈晃 ,藤渕 航: "網羅的mRNA絶対定量のためのパイロプライマーの開発 特定領域研究ライフサーベイヤ", 名古屋, 2008年2月1日.