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  • 論文（ポスター発表：2011年）

論　文（ポスター発表：2011年）

  • 大安 裕美, 広川 貴次, 神谷 成敏, 藤 博幸,: "プロスタグランジン受容体の基質認識機構の多様化", 第34回日本分子生物学会2011年会, パシフィコ横浜, 2011年12月16日
  • 崎山 則征, 今井 賢一郎, 富井 健太郎, Horton Paul,: "Mitochondrial targeting signal is major determinant of mitochondrial localizing mRNA", 第34回日本分子生物学会2011年会, パシフィコ横浜, 2011年12月15日
  • 今井 賢一郎, 富井 健太郎, 崎山 則征, 牧内 貴志, 村上 佳隆, 野崎 智義, Paul Horton: "Survey of Novel Mitosomal beta-barrel Outer Membrane Proteins in Entamoeba histolytica through Sequence Analysis", 第34回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜, 2011年12月15日
  • 伊藤 真和吏, 伊東 純一, 久保山 哲二, 富井 健太郎: "糖鎖−タンパク質認識に関する新規類似性尺度の構築", 第34回日本分子生物学会年会, パシフィコ横浜, 2011年12月14日
  • 山崎 智, 中村 周吾, 福井 一彦: "RNA tertiary structure prediction based on secondary structure and fragment structure library", 第34回日本分子生物学会年会, 神奈川県, 2011年12月14日
  • 富永 大介: "線虫の発生におけるステージ進行のデータからの定義と頻度解析", 第34回日本分子生物学会年会, 横浜, 2011年12月14日
  • 辻 淳子, Frith Martin, 富井 健太郎, Horton Paul,: "Mitochondrial DNA Insertions in Mammalian Nuclear Genomes Do Not Randomly Occur",第34回日本分子生物学会2011年会, パシフィコ横浜, 2011年12月14日
  • 深沢 嘉紀, Wan Raymond, 傅 思縉, 辻 淳子, 崎山 則征, 今井 賢一郎, Horton Paul,: "Computational analysis of mitochondrial cleaved proteins based on proteomic analyses", 第34回日本分子生物学会2011年会, パシフィコ横浜, 2011年12月14日
  • 市原 寿子, 藤 博幸,: "線虫Caenohabditis elegansゲノムの発現調節領域の進化解析", 第34回日本分子生物学会2011年会, パシフィコ横浜, 2011年12月14日
  • 辻 淳子, Frith Martin, 富井 健太郎, Horton Paul,: "Patterns of Mitochondrial DNA Insertion in Mammalian Nuclear Genomes", Cold Spring Harbor Asia Conference: Bioinformatics of Human and Animal Genomics, 中国, 2011年11月15日
  • 深沢 嘉紀, Wan Raymond, 傅 思縉, 辻 淳子, 崎山 則征, 今井 賢一郎, Horton Paul,: "MoiraiSP: a novel mitochondrial cleavage site predictor ", 2010年JSBi年会（CBI学会・JSBi 合同大会）, 神戸, 2011年11月10日
  • Horton Paul,: "fastapl and fastqpl, flexible tools for processing fasta and fastq format data", 2011年JSBi年会（CBI学会・JSBi 合同大会), 神戸, 2011年11月9日
  • 藤 博幸, 広川 貴次, 神谷 成敏, 大安 裕美,: "Computational Analysis of Ligand Recognition Mechanism by Prostanoid Receptors", 2011年JSBi年会（CBI学会・JSBi 合同大会), 神戸, 2011年11月9日
  • 伊藤 真和吏, 伊東 純一, 久保山 哲二, 富井 健太郎: "Developing a new similarity matrix of monosaccharides based on mechanisms of protein-glycan interactions", 2010年JSBi年会（CBI学会・JSBi 合同大会）, 神戸国際会議場, 2011年11月9日
  • 富永 大介: "Statistical Method to Search for the Optimal Division of Quantitative Time Series Data", JSBI/CBI 2011 合同年会, 神戸市, 2011年11月9日
  • 今井 賢一郎, 富井 健太郎, 崎山 則征, 牧内 貴志, 村上 佳隆, 野崎 智義, Paul Horton: "Sequence Analysis-based Survey of Novel Mitosomal beta-barrel Outer Membrane Proteins in E. histolytica", CBI/JSBi 2011合同大会, 神戸コンベンションセンター, 2011年11月8日
  • 本野 千恵, 小池 亮太郎, 清水 佳奈, 城田 松之, 雨宮 崇之, 富井 健太郎, 長野 希美, 佐藤 美和, 酒谷 尚史, 三十尾 潔高, 木寺 詔紀, 廣明 秀一, 白井 剛, 木下 賢吾, 野口 保, 太田 元規,: "SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins", CBI/JSBi 2011, 神戸, 2011年11月8日
  • 油谷 幸代: "Reconstruction of Transcriptional Regulatory Network by Structural Equation Modeling", CBI/JSBi 2011 合同大会, 神戸国際会議場, 2011年11月8日
  • 辻 淳子, Frith Martin, 富井 健太郎, Horton Paul,: "Common Features of DSB-mediated Exogenous DNA Integration Sites in Mammalian Nuclear Genomes", 2010年JSBi年会（CBI学会・JSBi 合同大会）, 神戸, 2011年11月8日
  • 廣瀬 修一, 花輪 孟, 松山 泰男, 野口 保,: "Analysis of intrinsically disordered proteins based on molecular evolution", 2011年JSBi年会（CBI学会・JSBi 合同大会), 神戸, 2011年11月8日
  • 本野 千恵, 小池 亮太郎, 清水 佳奈, 城田 松之, 雨宮 崇之, 富井 健太郎, 長野 希美, 佐藤 美和, 酒谷 尚史, 三十尾 潔高, 木寺 詔紀, 廣明 秀一, 白井 剛, 木下 賢吾, 野口 保, 太田 元規: "SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins", Protein Data Bank 40th Anniversary 2011, ニューヨーク, 2011年10月28日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 浅井 潔: "情報統合基盤技術を用いた配列・タンパク質ワークフロー解析", 産総研オープンラボ, つくば, 2011年10月13日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 浅井 潔: "情報統合基盤技術を用いた配列・タンパク質ワークフロー解析", トーゴーの日シンポジウム2011, 未来館, 2011年10月5日
  • 幡野 晶子, 千葉 啓和, 谷口 丈晃, 山根木 康嗣, 高井 貴子, 田中 博, 藤渕 航: "細胞分化解析を目指した網羅的ヒト細胞データベース「CELLPEDIA」", 2011統合データベースシンポジウム, 日本科学未来館, 2011年10月5日
  • 油谷 幸代: "Network Inference of the serial transcriptional regulation in yeast by Structure Equation Modeling", ICSB2011, Heiderberg, 29th Aug. 2011
  • 本野 千恵, 小池 亮太郎, 清水 佳奈, 城田 松之, 雨宮 崇之, 富井 健太郎, 長野 希美, 廣明 秀一, 白井 剛, 木下 賢吾, 野口 保, 太田 元規: "SAHG, a comprehensive database of annotated structure models for human proteins", ISMB/ECCB 2011, Austria, Vienna, 19th Jul. 2011
  • Paul Horton: "fastapl -- a utility for versatile and easy processing of multifasta format data", 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Austria, Vienna,, 19th Jul. 2011
  • 富井 健太郎, 伊東 純一, 田部井 靖生, 清水 佳奈, 津田 宏治: "A novel ultra-fast comparison method for known and potential ligand-binding sites of proteins", ISMB/ECCB 2011, Vienna, 18th Jul. 2011
  • Kazutaka Katoh, Christian Ledergerber, Christophe Dessimoz, Manuel Gil: "Effect of adding homologs in multiple sequence alignment and phylogenetic analysis", ISMB/ECCB2011, Austria, Vienna, 18th Jul. 2011
  • 長尾 章弘, 光山 統泰, Haidong Huang, Dahua Chen, 塩見 美喜子, 塩見 春彦: "Biogenesis pathways of piRNAs loaded onto AGO3 in the Drosophila testis", The 16th Annual Meeting of The RNA Society and The RNA Society of Japan 13th Annual Meeting, 京都, 2011年7月17日
  • 光山 統泰: "Identification of ncRNAs in syntenic genomic loci with the conserved secondary structures", The 16th Annual Meeting of the RNA Societn and The RNA Society of Japan 13th Annual Meeting, 京都, 2011年7月17日
  • Paul Horton, "fastapl - a utility for processing fasta format data", 12th Annual Bioinformatics Open Source Conference, Austlia, Vienna, 15th Jul. 2011
  • 伊東 純一, 田部井 靖生, 清水 佳奈, 富井 健太郎, 津田 宏治: "Pdb-wide discovery of similar ligand binding sites Using structural sketches", 3DSIG 2011, Vienna, 15th Jul. 2011
  • 伊藤 真和吏, 伊東 純一, 久保山 哲二, 富井 健太郎: "糖鎖−タンパク質認識に関する新規類似性尺度の構築", 第30回日本糖質学会年会, 長岡, 2011年7月12日
  • 廣瀬 修一, 野口 保: "タンパク質発現・可溶性予測システム（ＥＳＰＲＥＳＳＯ）の開発", 蛋白質科学会, 大阪, 2011年6月9日
  • 本野 千恵, 中田 淳一, 富井 健太郎, 清水 佳奈, 長野 希美, 野口 保, 廣明 秀一, 雨宮 崇之, 城田 松之, 小池 亮太郎, 白井 剛, 木下 賢吾, 太田 元規: "ヒトゲノム構造・機能アノテーションデータベースSAHG：高等生物由来タンパク質の構造予測パイプラインの開発とヒト由来全タンパク質への適用（SAHG, a structural and functional annotation database of proteins encoded in human genome)", 第11回日本蛋白質科学会年会, 大阪, 2011年6月8日
  • 花輪 孟, 廣瀬 修一, 野口 保: "分子進化的観点から見た天然変性タンパク質の解析", 第11回日本蛋白質科学会年会, 大阪, 2011年6月8日
  • 伊東 純一, 田部井 靖生, 清水 佳奈, 富井 健太郎, 津田 宏治: " Structural Sketchを用いたタンパク質リガンド類似結合部位の高速列挙とそのデータベース構築", 第11回日本蛋白質科学会年会, 大阪, 2011年6月8日
  • Kana Shimizu, Koji Tsuda: "SlideSort: A fast and exact tool for finding all similar pairs from next-generation sequencing data", RECOMB 2011, Vancouver, 29th Mar. 2011
  • 千葉 啓和, 岡村 好子, 珠玖 仁, 秋山 英雄, 竹山 春子, 藤渕 航: "OPTIMIZING PRIMERS FOR SEQUENCER-BASED QUANTITATION OF RNAS", The 5th International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis, The University of Tokyo, 2011年3月3日
  • 藤渕 航: "細胞情報解析に役立つバイオインフォマティクス", 産総研LS-BT研究発表会, つくば, 2011年2月1日
  • 本野 千恵, 広川 貴次: "タンパク質のコンキャビティ形状比較を用いたバーチャルスクリーニング", 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, 産総研つくばセンター, 2011年2月1日
  • 山崎 智, 中村 周吾, 福井 一彦: "二次構造予測結果に基づくRNA三次構造予測システムの開発", 第10回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2011年2月1日
  • 福井 一彦, 田代 俊行, 矢葺 幸光, 野口 保, 浅井 潔: "ライフサイエンス統合DBプロジェクトにおけるワークフロー開発", 第10回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2011年2月1日
  • 野口 保, 廣瀬 修一, 河村 義史, 森 正敏, 五島 直樹: "タンパク質可溶化タグ設計法の研究開発", 第10回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2011年2月1日
  • 富永 大介: "小サンプル時系列データの周期性の判定法", 第10回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2011年2月1日
  • 千葉 啓和, 田中 卓, 三宅 正人, 藤渕 航: "細胞分化制御のためのデータマイニング技術の開発", 第10回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, つくば, 2011年2月1日
  • 油谷 幸代: "Network Inference of AP pattern formation system in D.melanogaster", BiWO2011, 産総研 臨海副都心センター別館, 2011年1月25日