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  • 論文（ポスター発表：2006年）

論　文（ポスター発表：2006年）

  • Sakai, N., Yamamoto, S., Nakamura, H., Nakanishi, Y., Takagi, T., Fukuda, K.: "INOH Pathway Data Ontologies", GIW 2006 (The 17th International Conference on Genome Informatics), Yokohama, 18th Dec., 2006.
  • Kiseleva, L., Horton, P.: "Identification of tissue specific transcription factors using microarray gene expression data", GIW 2006 (The 17th International Conference on Genome Informatics), Yokohama, 18th Dec., 2006.
  • Okada, Y., Fujibuchi, W., Horton, P.: "Module discovery in gene expression data using closed itemset mining algorithm", GIW 2006 (The 17th International Conference on Genome Informatics), Yokohama, 18th Dec., 2006.
  • Tominaga, D., Horimoto, K.: "An S-system Application for Mammalian Circadian Clock System". GIW 2006 (The 17th International Conference on Genome Informatics), Yokohama, 2006年12月18日.
  • 広川 貴次, 森 芳和, 青木 勝之, 里見 尚則, 新津 和明, 諸田 隆, 竹田 秀一: "分子モデリング技術を利用したPDGFβレセプターに対するオキソキノキサリン誘導体の構造活性相関". 第25回メディシナルケミストリシンポジウム, 名古屋, 2006年11月30日
  • Shimizu, K., Hirose, S., Inoue, N., Kanai, S., Noguchi, T.: "POODLE: predicting protein disorder using machine-learning approaches", Seventh Community Wide Experiment on the Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction, Asilomar Conference Center, Pacific Grove, USA, 27th Nov., 2006.
  • Tomii, K., Sawada, Y., Honda, S.: "Correlation between sequence profiles and profiles derived from local structural classifications", EABS & BSJ 2006 Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Okinawa, 16th Nov., 2006.
  • Gromiha, M.M., Suresh, X., Suwa, M.: "Membrane protein-ligand interactions: New insights from statistical analysis and molecular modeling studies", EABS & BSJ 2006 Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Okinawa, 16th Nov., 2006.
  • Gromiha, M.M., Ahmad, S., Prabakaran, P., Sarai, A.: "Classification of protein-DNA complexes based on structural descriptors", EABS & BSJ 2006 Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Okinawa, 16th Nov., 2006.
  • Iwaya, N., Unzai, S., Tomii, K., Goda, N., Tochio, H., Shirakawa, M., Hiroaki, S.: "Molecular basis of microtubule disassembly mechanism regulated by Katanin p60", EABS & BSJ 2006 Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Okinawa, 16th Nov., 2006.
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  • Nagano, N.: "Systematic Analyses of Catalytic Mechanisms of Hydrolysis and Transfer Reactions". EABS & BSJ 2006, 沖縄, 2006年11月16日.
  • Naoko Iwaya, Satoru Unzai, 富井 健太郎, 合田 名都子, 栃尾 豪人, 白川 昌宏, 廣明 秀一: "Molecular basis of microtubule disassembly mechanism regulated by Katanin p60". EABS & BSJ 2006, 沖縄, 2006年11月13日.
  • 富井 健太郎, 本野 千恵, 佐藤 美和, 太田 元規, 酒谷 尚史, 藤原 康弘, 三十尾 潔高, 広川 貴次, Palul Hotron, 秋山 泰: "立体構造予測実験CASP7に対するとり組み", CBRC2006 生命情報科学研究センター 2006年度 研究報告シンポジウム, 2006年9月28日.
  • 本野 千恵, 藤原 康弘, 三十尾 潔高, 佐藤 美和, 酒谷 尚史, 富井 健太郎, 広川 貴次, 秋山 泰: "タンパク質立体構造予測システムFORTE-SUITEの自動化・並列化", CBRC2006 生命情報科学研究センター 2006年度 研究報告シンポジウム, 2006年9月28日.
  • 岡田 吉史: "マイクロアレイデータからの遺伝子発現モジュールの抽出", CBRC2006 生命情報科学研究センター 2006年度 研究報告シンポジウム, 2006年9月28日.
  • Fukuda, K., Yamamoto, S., Sakai, N., Nakamura, H., Takagi, T.: "INOH pathway data ontologies", ISMB2006, Fortaleza, Brazil, 6th Aug., 2006.
  • Michael Gromiha, 諏訪 牧子: "Discrimination of beta-barrel Membrane Proteins: Comparison between Statistical Methods and Machine Learning Algorithms", CBI学会2006年大会, Tokyo, 25th July, 2006.
  • Gromiha, M.M., Suwa, M.: "Sequence and Structural Analysis of b-barrel Membrane Proteins: Applications to Discrimination", 20th IUBMB International congress, Kyoto, 22nd June, 2006.
  • Gromiha, M.M., Suresh, X., Suwa, M.: "Analysis and understanding of membrane protein-ligand interactions using novel statistical parameters", 20th IUBMB International congress, Kyoto, 22nd June, 2006.
  • Aburanani, S.: "Inference of Cell Cycle Regulatory Network from Expression Profiles by Graphical Chain Modeling". 20th IUBMB International congress, Kyoto, 2006年6月22日.
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  • Fujibuchi, W., Taniguchi, T., Ohkubo, K., Okada, Y.: "Human nomal cell catalog database: gene expressions, structures and functions". 20th IUBMB International congress, Kyoto, 200年6月22日.
  • Hirokawa, T.: "Molecular Modeling and in silico Screening for the Human Histamine H1 Receptor". Structure-based drug design, Boston, 2006年6月15日
  • Fukui, K.: "Photodissociation study of Peptides and Oligosaccharides by Infrared Spectroscopy using FTMS-FEL-SUT". 54th ASMS Conference on Mass Spectrometry, Seattle, 2006年5月29日.
  • 富永 大介: "時系列データの周期性の有無を客観的に判定する方法". 第5回 国際バイオEXPO & FORUM, 東京, 2006年5月17日.
  • Michael Gromiha, Xavier Suresh, 諏訪 牧子: "Understanding the complexity of membrane protein-ligand interactions: derivation of novel statistical parameters", 第6回日本蛋白質科学会年会, 京都, 2006年4月26日.
  • 廣瀬 修一, 清水 佳奈, 金井 理, 野口 保: "2ステップSVMによる長いdisorder領域予測システムの開発", 第6回日本蛋白質科学会年会, 京都, 2006年4月26日.
  • 清水 佳奈, 廣瀬 修一, 村岡 洋一, 野口 保: "構造が未知な配列データを使ったディスオーダータンパク質の予測", 第6回日本蛋白質科学会年会, 京都, 2006年4月26日.
  • Michael Gromiha: "Prediction of protein folding rates from amino acid sequence", 第6回日本蛋白質科学会年会, 京都, 2006年4月25日.
  • 岩谷 奈央子, 合田 名都子, 富井 健太郎, 栃尾 豪人, 白川 昌宏, 廣明 秀一: "微小管分解を制御するKatanin p60 N末端ドメインの立体構造と機能の解析", 第6回日本蛋白質科学会年会, 京都, 2006年4月25日.
  • Fujibuchi, W., Taniguchi, T., Kiseleva, L., Horton, P.: "HUMAN CELL TYPE AND MORPHOLOGY PREDICTION BY GENE EXPRESSION PATTERNS", SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION, Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA, 24th Mar., 2006.
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  • Horton, P., Park, K.J., Nakai, K.: "Protein Subcellular Localization Prediction with WoLF PSORT", RECOMB 2006, Venice Lido, Italy, 4th Apr., 2006.
  • Fujibuchi, W., Kiseleva, L., Horton, P.: "Cell typing by expression profile: A new look at an old problem", RECOMB 2006, Venice Lido, Italy, 4th Apr., 2006.
  • Fukui, K.: "IRMPD Spectroscopic Analysis of Peptides and Oligosaccharides Using FTICR With Mid-Infrared Free-Electron Laser", APS 2006, Baltimore, MD, USA, 13th Mar., 2006.
  • Sekijima, M., Motono, C., Akiyama, Y., Kaneko, K., Noguchi, T.: "Molecular Dynamics Simulation of Prion Protein from Mouse, Dog, Cat, Pig, Sheep, Cattle, and Human: Insight into Property Differences", Biophysical Society 50th Annual Meeting, Salt Lake City, USA, 20th Feb., 2006.
  • Tominaga, D., Horton, P.: "NON-ARBITRARY JUDGMENT ALGORITHM FOR PERIODICITY OF TIME SERIES DATA", The Fourth Asia Pacific Bioinformatics Conference, Okazaki, Taipei City, Taiwan, 13th Feb., 2006.
  • 富永 大介, Paul Horton: "遺伝子発現時系列データからの周期性変動抽出の自動化", 平成17年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会　合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2006年2月2日.
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  • 向井 有理, 広川 貴次, 富井 健太郎, 浅井 潔, 秋山 泰, 諏訪 牧子: "GGtraP: ゴルジ膜貫通領域に着目した糖転移酵素検出ツール", 平成17年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会　合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2006年2月2日.
  • 清水 佳奈, 野口 保, 富井 健太郎, 廣瀬 修一: "タンパク質Disorder領域およびドメインの予測", 平成17年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会　合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2006年2月2日.
  • 池田 修己, 向井 有理, 矢葺 幸光, 諏訪 牧子: "膜タンパク質配列─立体構造情報帰属システムの開発", 平成17年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会　合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2006年2月2日.
  • 福井 一彦: "波長可変レーザーを用いた糖鎖・糖ペプチドの赤外多光子励起", 平成17年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会　合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2006年2月2日.
  • 長崎 英樹, 諏訪 牧子, 有田 正規, 西澤 達也, 後藤 修: "6真核生物種における選択的スプライシングと選択的転写開始の種特異性", 平成17年度ライフサイエンス分野融合会議・生命工学部会バイオテクノロジ−研究会　合同研究発表会・講演会, 産業技術総合研究所, つくば, 2006年2月2日.
  • Tominaga, D., Horton, P: "Piccolo: Non-arbitrary periodicity judgment of time-series data based on BIC and DFT",The Pacific Symposium on Biocomputing 2006, Maui, HI, USA, 3rd Jan., 2006.
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